More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0183 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0183  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.766469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1058  peptidyl-tRNA hydrolase  40.11 
 
 
187 aa  131  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  36.57 
 
 
185 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  38.15 
 
 
213 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02831  peptidyl-tRNA hydrolase  34.3 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.396706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
207 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
210 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  34.3 
 
 
205 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  34.46 
 
 
232 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
186 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3122  peptidyl-tRNA hydrolase  35.39 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.984207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0090  peptidyl-tRNA hydrolase  35.39 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.77 
 
 
187 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  36.78 
 
 
195 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.52 
 
 
206 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 
189 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  35.8 
 
 
207 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
213 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1409  peptidyl-tRNA hydrolase  43.67 
 
 
190 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0451153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1922  peptidyl-tRNA hydrolase  39.43 
 
 
196 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1089  peptidyl-tRNA hydrolase  38.65 
 
 
217 aa  122  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  35.85 
 
 
189 aa  121  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  38.41 
 
 
186 aa  121  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  36.31 
 
 
192 aa  121  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24601  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 
206 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  38.41 
 
 
186 aa  120  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  35.12 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  34.09 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  37.43 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  34.71 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  41.48 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  37.08 
 
 
205 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  35.8 
 
 
192 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  36.78 
 
 
188 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1379  peptidyl-tRNA hydrolase  41.51 
 
 
192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  35.39 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1627  peptidyl-tRNA hydrolase  39.78 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.660591  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0841  peptidyl-tRNA hydrolase  39.05 
 
 
197 aa  118  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000003517  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  35.63 
 
 
209 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  36.88 
 
 
202 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  34.81 
 
 
189 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  37.57 
 
 
213 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  35.12 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  35.12 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0182  peptidyl-tRNA hydrolase  37.18 
 
 
190 aa  117  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  35.12 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  39.87 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02721  peptidyl-tRNA hydrolase  33.91 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.778009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  34.57 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02731  peptidyl-tRNA hydrolase  35.47 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  35.23 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  36.25 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  35.8 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0583  peptidyl-tRNA hydrolase  37.64 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.258134  normal  0.0303401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  34.52 
 
 
193 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  37.79 
 
 
190 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03281  peptidyl-tRNA hydrolase  36.25 
 
 
202 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0728  peptidyl-tRNA hydrolase  34.12 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116266 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0252  peptidyl-tRNA hydrolase  33.72 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  36.47 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  35.03 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  35.03 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  34.25 
 
 
191 aa  114  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  34.25 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  34.68 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  39.13 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  37.58 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4135  peptidyl-tRNA hydrolase  36.52 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5242  peptidyl-tRNA hydrolase  40.51 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  39.24 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04540  peptidyl-tRNA hydrolase  32.94 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  39.1 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  32.77 
 
 
214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  35.8 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.15 
 
 
196 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  40.25 
 
 
199 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  38.82 
 
 
194 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  34.83 
 
 
201 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2205  peptidyl-tRNA hydrolase  32.93 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1054  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.29 
 
 
198 aa  111  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.18 
 
 
213 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2079  peptidyl-tRNA hydrolase  33.68 
 
 
206 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6134  peptidyl-tRNA hydrolase  35.39 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.014975  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.15 
 
 
196 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  37.09 
 
 
213 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  35 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2815  peptidyl-tRNA hydrolase  35.39 
 
 
199 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490887  normal  0.867617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2766  peptidyl-tRNA hydrolase  38.37 
 
 
188 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.720663  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  31.93 
 
 
185 aa  110  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  33.14 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  34.48 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>