225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2138 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  971    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  69.04 
 
 		 493 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  48.23 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  51.26 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  51.45 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  50.74 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  50.53 
 
 		 473 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  48.23 
 
 		 475 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  47.01 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  47.36 
 
 		 482 aa  422  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  52.45 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  43.5 
 
 		 475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  43.8 
 
 		 498 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  43.6 
 
 		 498 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  44.16 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  51.02 
 
 		 478 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  42.79 
 
 		 469 aa  316  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  44.37 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  40.67 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  49 
 
 		 479 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  36.02 
 
 		 502 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  37.59 
 
 		 486 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  41.09 
 
 		 486 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  40.79 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  39.87 
 
 		 508 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  41.08 
 
 		 486 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  37.88 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  37.88 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  37.88 
 
 		 484 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  34.17 
 
 		 491 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  34.9 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  34.82 
 
 		 489 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  35.23 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  33.62 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  35.34 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  36.32 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  33.82 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  33.92 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  33.92 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  33.18 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  36.58 
 
 		 483 aa  218  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  34.8 
 
 		 494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  34.09 
 
 		 498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  41.32 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  34.03 
 
 		 491 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  35.61 
 
 		 481 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  36.73 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  40.74 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  36.16 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  37.61 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  37.61 
 
 		 478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  33.69 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  38.05 
 
 		 483 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  37.31 
 
 		 478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  38.24 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  37.31 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  34.16 
 
 		 484 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  35.58 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  38.74 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  37.01 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  35.61 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  37.01 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  37.01 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  37.98 
 
 		 494 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  38.05 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  40.06 
 
 		 487 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  37.68 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  32.21 
 
 		 485 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  34.85 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  31.3 
 
 		 493 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  34.25 
 
 		 492 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  32.17 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  34.69 
 
 		 500 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  35.82 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  32.92 
 
 		 500 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  35.51 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  31.04 
 
 		 507 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  39.45 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  38.3 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  30.43 
 
 		 501 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  36.42 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  31.94 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  38.36 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  38.36 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  31.72 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  36.42 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  36.79 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  39.94 
 
 		 486 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  33.47 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  35.86 
 
 		 487 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  40.45 
 
 		 487 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  33.47 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  34.95 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  33.93 
 
 		 491 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  40.25 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  35.53 
 
 		 480 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>