225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4628 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  70.64 
 
 		 479 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  945    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  72.55 
 
 		 498 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  72.25 
 
 		 459 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  72.55 
 
 		 498 aa  665    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  58.21 
 
 		 477 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  57.96 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  55.11 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  52.62 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  52.65 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  42.67 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  44.95 
 
 		 475 aa  349  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  42.46 
 
 		 473 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  40.09 
 
 		 485 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  43.5 
 
 		 478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  40.35 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  41.54 
 
 		 482 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  40.95 
 
 		 475 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  49.43 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  42.71 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  35.08 
 
 		 489 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  37.31 
 
 		 494 aa  220  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  38.04 
 
 		 484 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  35.81 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  35.81 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  35.81 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  35.87 
 
 		 508 aa  216  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  38.63 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  36.54 
 
 		 493 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  40.58 
 
 		 491 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  36.94 
 
 		 483 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  39.34 
 
 		 492 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  38.35 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  39.87 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  38.97 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  33.79 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  37.97 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  36.29 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  37.4 
 
 		 502 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  37.9 
 
 		 505 aa  206  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  38.97 
 
 		 497 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  33.96 
 
 		 489 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  34.29 
 
 		 483 aa  206  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  39.74 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  38.05 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  38.28 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  33.07 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  33.43 
 
 		 480 aa  203  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  39.29 
 
 		 481 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  33.7 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  34.25 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  33.51 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  39.19 
 
 		 486 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  40.13 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  39.29 
 
 		 481 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  40.26 
 
 		 494 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  34.43 
 
 		 497 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.85 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.51 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  34.99 
 
 		 485 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  40.7 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  39.78 
 
 		 486 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  37.94 
 
 		 480 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  38.49 
 
 		 491 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  34.23 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  36.46 
 
 		 481 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  34.28 
 
 		 487 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  34.28 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  36.1 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  39.02 
 
 		 487 aa  193  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  35.86 
 
 		 472 aa  193  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  35.59 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  35.59 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  36.19 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  33.78 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  38.21 
 
 		 494 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  36.74 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  40.78 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  32.11 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  36.73 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  38.6 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  38.05 
 
 		 491 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  38.87 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  38.05 
 
 		 491 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  37.57 
 
 		 491 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  36.39 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  33.42 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  34.83 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  34.72 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  33.42 
 
 		 478 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  32.56 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  33.85 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6099  protein of unknown function UPF0061  37.39 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  32.43 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  31.19 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  31.07 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  31.64 
 
 		 488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>