225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1584 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1006    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  63.24 
 
 
475 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  58.87 
 
 
485 aa  578  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  58.56 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  57.38 
 
 
475 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  58.35 
 
 
473 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  57.41 
 
 
474 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  56.07 
 
 
482 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  50.82 
 
 
493 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  51.45 
 
 
478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  44.63 
 
 
477 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  43.37 
 
 
478 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  42.74 
 
 
469 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  39.84 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  42.64 
 
 
498 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  42.64 
 
 
498 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  42.71 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  41.46 
 
 
474 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  42.32 
 
 
459 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  41.44 
 
 
479 aa  299  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.21 
 
 
540 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  39.58 
 
 
486 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.89 
 
 
486 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.89 
 
 
486 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  40.18 
 
 
483 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  39.63 
 
 
487 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  39.68 
 
 
487 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  34.68 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  34.68 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  34.68 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  38.83 
 
 
487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  38.32 
 
 
508 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  36.29 
 
 
489 aa  226  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  36.88 
 
 
492 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  35.92 
 
 
494 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  37.2 
 
 
489 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  36.27 
 
 
483 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  35.22 
 
 
492 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  38.52 
 
 
487 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  33.19 
 
 
502 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  40.24 
 
 
487 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  36.22 
 
 
488 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  33.12 
 
 
487 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  33.12 
 
 
483 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  34.04 
 
 
473 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  34.35 
 
 
492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  34.46 
 
 
480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  36.69 
 
 
522 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  37.13 
 
 
485 aa  216  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  36.7 
 
 
484 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  32.91 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  35.26 
 
 
478 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  36.18 
 
 
522 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  36.18 
 
 
522 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  38.21 
 
 
480 aa  213  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4063  hypothetical protein  36.7 
 
 
484 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.145391  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  37.54 
 
 
478 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  36.44 
 
 
484 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  35.43 
 
 
480 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  37.54 
 
 
478 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  35.92 
 
 
522 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  35.43 
 
 
480 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  36.18 
 
 
522 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  37.23 
 
 
478 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  35.94 
 
 
494 aa  211  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  31.97 
 
 
483 aa  211  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  37.23 
 
 
478 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  36.17 
 
 
484 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  37.23 
 
 
478 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  34.65 
 
 
480 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  36.44 
 
 
484 aa  210  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  35.92 
 
 
540 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  37.23 
 
 
478 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  35.17 
 
 
480 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  36.61 
 
 
481 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3659  hypothetical protein  38.62 
 
 
484 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  32.56 
 
 
491 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  38.02 
 
 
504 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  33.12 
 
 
492 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  35.26 
 
 
480 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  35.26 
 
 
480 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  35.09 
 
 
510 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  40 
 
 
486 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  36.92 
 
 
478 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  37.29 
 
 
518 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  34.01 
 
 
494 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  33.4 
 
 
491 aa  206  7e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  37.93 
 
 
486 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  33.17 
 
 
500 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  36.92 
 
 
478 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  33.56 
 
 
506 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  37.02 
 
 
518 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  38.57 
 
 
481 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  35.27 
 
 
481 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  36.56 
 
 
483 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  31.62 
 
 
491 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  32.97 
 
 
485 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  31.34 
 
 
497 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  39.93 
 
 
493 aa  203  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  33.47 
 
 
498 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>