225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28081 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  69.04 
 
 
478 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1013    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  50.1 
 
 
473 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  48.57 
 
 
474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  50.62 
 
 
473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  49.69 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  50.82 
 
 
492 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  47.35 
 
 
485 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  46.89 
 
 
482 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  47.06 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  41.63 
 
 
498 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  41.43 
 
 
498 aa  322  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  51.87 
 
 
477 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  41.99 
 
 
459 aa  316  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  49.43 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  40.25 
 
 
478 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  45.99 
 
 
478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  45.74 
 
 
469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  40.35 
 
 
474 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  39 
 
 
479 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.48 
 
 
486 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.48 
 
 
540 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.48 
 
 
486 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.18 
 
 
486 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  32.38 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  32.38 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  32.38 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5028  hypothetical protein  36.62 
 
 
487 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  32.06 
 
 
502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  37.05 
 
 
481 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  35.93 
 
 
481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  37.58 
 
 
487 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  36.36 
 
 
473 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  35.21 
 
 
508 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  32.62 
 
 
483 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  32.54 
 
 
500 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  31.5 
 
 
485 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  35.07 
 
 
487 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  36.86 
 
 
494 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  32.69 
 
 
498 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  30.64 
 
 
489 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  37.46 
 
 
487 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  33.26 
 
 
494 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  32.07 
 
 
489 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  34.48 
 
 
486 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  32.77 
 
 
512 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  32.21 
 
 
491 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  37.28 
 
 
480 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  32.29 
 
 
497 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  31.84 
 
 
483 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  33.18 
 
 
500 aa  203  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  34.24 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  32.9 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  33.42 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  35.71 
 
 
494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  32.4 
 
 
491 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  38.68 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  35.98 
 
 
488 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  32.1 
 
 
500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  32.4 
 
 
491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  34.13 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  38.68 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  38.68 
 
 
484 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  36.39 
 
 
483 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0444  hypothetical protein  34.64 
 
 
487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.734273  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  37.5 
 
 
484 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  32.2 
 
 
482 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  31.25 
 
 
491 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  38.73 
 
 
483 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  32.67 
 
 
517 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  38.73 
 
 
487 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  34.49 
 
 
492 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  33.5 
 
 
497 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  33.14 
 
 
480 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  31.86 
 
 
492 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  36.03 
 
 
483 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  30.16 
 
 
491 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  32.71 
 
 
491 aa  193  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  37.23 
 
 
484 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  36.84 
 
 
478 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  36.84 
 
 
478 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  32.91 
 
 
485 aa  192  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  32.9 
 
 
483 aa  192  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  36.49 
 
 
478 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0308  hypothetical protein  36.84 
 
 
483 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0254223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  33.76 
 
 
496 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  37.06 
 
 
481 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  36.49 
 
 
478 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  31.9 
 
 
497 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1366  hypothetical protein  32.03 
 
 
490 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  31.9 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  36.04 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  31.17 
 
 
485 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  37.32 
 
 
484 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  36.14 
 
 
478 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  36.14 
 
 
478 aa  190  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  32.74 
 
 
481 aa  190  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  31.47 
 
 
491 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  37.32 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  36.14 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>