225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4180 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1004    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  98.59 
 
 		 498 aa  993    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  72.55 
 
 		 475 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  92.37 
 
 		 459 aa  855    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  71.82 
 
 		 479 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  58.97 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  58.12 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  54.83 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  52.45 
 
 		 478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  52.43 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  42.29 
 
 		 473 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  41.72 
 
 		 473 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  42.23 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  40.45 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  41.98 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  41 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  41.08 
 
 		 474 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  41.63 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  43.6 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  42.16 
 
 		 492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  34.54 
 
 		 483 aa  226  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  37 
 
 		 508 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  31.62 
 
 		 489 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  31.3 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  34.59 
 
 		 491 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  33.42 
 
 		 483 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  32.41 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  32.41 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  32.41 
 
 		 484 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  34.89 
 
 		 483 aa  213  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  35.16 
 
 		 494 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  34.07 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  36.83 
 
 		 484 aa  211  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  35.98 
 
 		 483 aa  209  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  35.98 
 
 		 487 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  36.5 
 
 		 494 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  37.07 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  40.21 
 
 		 486 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  35.28 
 
 		 502 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  40.21 
 
 		 540 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  36.51 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  30.85 
 
 		 483 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  39.86 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  39.86 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  35.36 
 
 		 473 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  33.96 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  31.96 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  34.78 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  35.6 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  33.62 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  34.29 
 
 		 483 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  33.62 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  33.62 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  35.79 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  38.64 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  33.62 
 
 		 480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  33.72 
 
 		 485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  34.24 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  35.94 
 
 		 493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  34.13 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  35.13 
 
 		 518 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  31.31 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  38.26 
 
 		 485 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  31.57 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  31.57 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  38.28 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  38.71 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  35.77 
 
 		 481 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  39.58 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  32.41 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  31.31 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  35.51 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  35.17 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  31.91 
 
 		 517 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  35.21 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  36.86 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  31.31 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  34.86 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  31.06 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  30.81 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  31.31 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  31.06 
 
 		 478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  36.8 
 
 		 494 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  35.96 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  37.92 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  33.42 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  34.58 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  34.6 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  37.81 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  37.38 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  35.96 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  29.65 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  34.84 
 
 		 491 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  37.71 
 
 		 459 aa  186  7e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  35.97 
 
 		 488 aa  186  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  32.36 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  33.49 
 
 		 495 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  33.51 
 
 		 485 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  34.82 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  34.47 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>