225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0344 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  70.64 
 
 		 475 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  72.46 
 
 		 498 aa  672    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  72.25 
 
 		 459 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  71.82 
 
 		 498 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  964    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  58.53 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  57.14 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  55.58 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  51.91 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  50.42 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  43.44 
 
 		 475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  42.54 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  41.51 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  42.32 
 
 		 473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  42.08 
 
 		 482 aa  322  9.000000000000001e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  42.18 
 
 		 475 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  39.96 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  41.44 
 
 		 492 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  49 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  39 
 
 		 493 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  35.15 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  35.15 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  35.15 
 
 		 484 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  38.3 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  36.59 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  36.94 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  36.97 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  41.25 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  38.78 
 
 		 491 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  33.6 
 
 		 489 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  38.24 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  41.18 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  40.48 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  37.14 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  36.31 
 
 		 473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  35.97 
 
 		 497 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  37.97 
 
 		 497 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  35.03 
 
 		 488 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  38.17 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  35.53 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  34.67 
 
 		 488 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  37.04 
 
 		 491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  35.28 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  40.7 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  40.7 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  38.56 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  38.68 
 
 		 485 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  35.31 
 
 		 472 aa  196  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  32.98 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  34.49 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  35.14 
 
 		 505 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  37.22 
 
 		 498 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  43.31 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  38.13 
 
 		 480 aa  195  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  40.35 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  34.51 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  35.81 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  39.61 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  35.11 
 
 		 485 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  32.66 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  35.83 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  35.83 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  37.9 
 
 		 502 aa  194  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  33.96 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  37.26 
 
 		 500 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  34.4 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  34.22 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  34.4 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  34.4 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  34.4 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  34.58 
 
 		 485 aa  192  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  34.4 
 
 		 488 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  38.89 
 
 		 486 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  38.89 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  35.83 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  36.25 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  37.94 
 
 		 492 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.33 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  37.58 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  34.48 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  34.22 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  35.83 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  34.18 
 
 		 483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  36.39 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  35.5 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.19 
 
 		 486 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  34.34 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  34.56 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  34.28 
 
 		 478 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  32.08 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  33.86 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  34.56 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  34.91 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  34.28 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  34.28 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  37.03 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  32.47 
 
 		 480 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  34.28 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  33.06 
 
 		 484 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  34.28 
 
 		 478 aa  186  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>