225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0926 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  959    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  58.86 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  59.45 
 
 		 480 aa  541  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  58.21 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  55.83 
 
 		 483 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  55.01 
 
 		 500 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  56.42 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  55.82 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  56.42 
 
 		 491 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  54.62 
 
 		 500 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  55.82 
 
 		 497 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  52.61 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  55.62 
 
 		 498 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  53.86 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  55.76 
 
 		 494 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  54.79 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  54.83 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  54.67 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  55.74 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  54.49 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  54.88 
 
 		 492 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  52.61 
 
 		 507 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  54.23 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  54.73 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  54.71 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  51.98 
 
 		 492 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  52.08 
 
 		 488 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  51.97 
 
 		 491 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  51.98 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  52.66 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  51.88 
 
 		 488 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  51.67 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  51.67 
 
 		 488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  55.32 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  51.88 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  51.46 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  54.55 
 
 		 485 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  51.46 
 
 		 488 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  51.04 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  51.77 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  53.56 
 
 		 491 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  54.37 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  54.17 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  52.46 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  50.82 
 
 		 493 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  54.34 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  54.34 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  48.96 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  50.83 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  52.25 
 
 		 500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  51.66 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  50.31 
 
 		 497 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  47.84 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  47.28 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  44.71 
 
 		 501 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  50.92 
 
 		 487 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  45.25 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  52.35 
 
 		 499 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  50.92 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  46.97 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  48.97 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  49.59 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  49.59 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  47.67 
 
 		 494 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  49.48 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  50.96 
 
 		 482 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  48.04 
 
 		 491 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  48.1 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  47.42 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  46.03 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  44.94 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  44.26 
 
 		 498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  42.45 
 
 		 492 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  41.65 
 
 		 506 aa  339  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  42.6 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  42.6 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  42.6 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  42.8 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  40.84 
 
 		 486 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  43.64 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  44.01 
 
 		 518 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  42.6 
 
 		 540 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  41.65 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  41.65 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  41.65 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  40.84 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  42.19 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  41.3 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  43.01 
 
 		 488 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  41.99 
 
 		 522 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  43.27 
 
 		 525 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  43.27 
 
 		 521 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  43.27 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  43.27 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  43.27 
 
 		 521 aa  329  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  43.72 
 
 		 521 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  41.14 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  43.39 
 
 		 518 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  41.14 
 
 		 478 aa  329  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  41.14 
 
 		 478 aa  328  9e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>