225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3269 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  981    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  63.06 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  62.45 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  62.17 
 
 		 517 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  59.96 
 
 		 491 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  58.93 
 
 		 491 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  58.2 
 
 		 492 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  58.61 
 
 		 492 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  57.37 
 
 		 498 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  57.67 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  57.58 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  57.52 
 
 		 494 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  57.82 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  57.58 
 
 		 497 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  58.02 
 
 		 491 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  57.55 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  56.49 
 
 		 481 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  57.58 
 
 		 492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  56.08 
 
 		 481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  55.88 
 
 		 481 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  53.5 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  55.83 
 
 		 472 aa  511  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  50.83 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  51.45 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  54.64 
 
 		 505 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  50.92 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  56.73 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  54.85 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  54.47 
 
 		 481 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  51.45 
 
 		 491 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  54.62 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  49.79 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  50.21 
 
 		 488 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  51.95 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  49.79 
 
 		 488 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  50.21 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  55.44 
 
 		 500 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  50 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  49.79 
 
 		 488 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  54.83 
 
 		 491 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  50.82 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  53.17 
 
 		 494 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  54.83 
 
 		 491 aa  495  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  52.57 
 
 		 493 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  50 
 
 		 507 aa  485  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  54.73 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  50.51 
 
 		 497 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  51.24 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  49.48 
 
 		 485 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  50.21 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  52.38 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  50.72 
 
 		 483 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  47.53 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  51.33 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  46.38 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  47.76 
 
 		 484 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  50.82 
 
 		 487 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  45.96 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  51.33 
 
 		 499 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  45.71 
 
 		 501 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  48.78 
 
 		 494 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  50.51 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  50.51 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  50.31 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  49.18 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  47.88 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  47.53 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  47.01 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  47.15 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  43 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  44.38 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  45.57 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  44.4 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  45.77 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  45.57 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  42.64 
 
 		 486 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  45.57 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  45.57 
 
 		 525 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  45.57 
 
 		 525 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  45.57 
 
 		 521 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  42.42 
 
 		 540 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  47.11 
 
 		 521 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  44.63 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  42.64 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  44.63 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  44.7 
 
 		 522 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  42.24 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  42.37 
 
 		 486 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  44.51 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  44.1 
 
 		 522 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  43.92 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  43.92 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  43.92 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  44.4 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  43.66 
 
 		 488 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  43.48 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  41.82 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  44.54 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  41.47 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  41.47 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>