225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4892 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  72.1 
 
 
491 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  77.31 
 
 
498 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  65.78 
 
 
491 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  76.71 
 
 
497 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  68.65 
 
 
491 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  65.57 
 
 
492 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  970    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  67.83 
 
 
491 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  67.21 
 
 
492 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  76.31 
 
 
497 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  71.93 
 
 
502 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  65.24 
 
 
492 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  67.28 
 
 
494 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  63.19 
 
 
500 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  60.25 
 
 
505 aa  587  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  61.55 
 
 
500 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  61.32 
 
 
505 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  63.04 
 
 
494 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  59.26 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  59.71 
 
 
481 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  61.73 
 
 
471 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  61.13 
 
 
499 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  57.61 
 
 
491 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  55.97 
 
 
492 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  56.38 
 
 
485 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  57.55 
 
 
483 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  51.84 
 
 
488 aa  524  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  52.86 
 
 
491 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  51.43 
 
 
488 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  51.65 
 
 
488 aa  519  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  57.23 
 
 
480 aa  521  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  58.2 
 
 
481 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  58.61 
 
 
481 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  51.02 
 
 
488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  51.03 
 
 
488 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  50.82 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  58.49 
 
 
491 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  50.62 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  51.23 
 
 
488 aa  511  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  58.49 
 
 
491 aa  512  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  50.41 
 
 
488 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  50.41 
 
 
488 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  52.67 
 
 
491 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  57.58 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  56.42 
 
 
472 aa  501  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  52.85 
 
 
493 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  56.66 
 
 
500 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  52.03 
 
 
493 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  56.91 
 
 
481 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  53.39 
 
 
483 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  56.91 
 
 
481 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  58.01 
 
 
512 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  57.11 
 
 
481 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  56.93 
 
 
485 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  47.95 
 
 
484 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  49.79 
 
 
507 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  55.18 
 
 
482 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  49.79 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  51.72 
 
 
497 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  52.52 
 
 
494 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  48.99 
 
 
484 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  52.67 
 
 
487 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  46.12 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  53.49 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  46.73 
 
 
490 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  45.14 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  57.6 
 
 
486 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  45.4 
 
 
485 aa  425  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  48.85 
 
 
488 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  47.38 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  51.57 
 
 
498 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  48.84 
 
 
492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  47.18 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  46.37 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  46.22 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  46.41 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  46.22 
 
 
522 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  47.62 
 
 
522 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  47.71 
 
 
525 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  47.7 
 
 
525 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  47.71 
 
 
521 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  46.59 
 
 
540 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  43.86 
 
 
506 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  47.71 
 
 
525 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  47.71 
 
 
525 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  47.71 
 
 
521 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  44.03 
 
 
487 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  44.03 
 
 
483 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  48.11 
 
 
521 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  47.51 
 
 
521 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  46.06 
 
 
498 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  45.53 
 
 
520 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  44.58 
 
 
500 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  46.39 
 
 
522 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  47.88 
 
 
475 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  45.98 
 
 
522 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  45.89 
 
 
497 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  46.86 
 
 
507 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  47.52 
 
 
525 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  43.65 
 
 
496 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0720636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>