225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  946    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  51.65 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  51.03 
 
 		 485 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  51.15 
 
 		 512 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  50.62 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  51.04 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  50.41 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  48.59 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  50.1 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  50.1 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  48.23 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  48.64 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  47.61 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  49.3 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  49.6 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  47.4 
 
 		 481 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  45.33 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  47.88 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  45.33 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  43.88 
 
 		 505 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  48.2 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  46.83 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  46.83 
 
 		 491 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  45.49 
 
 		 505 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  45.21 
 
 		 492 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  46.17 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  46.15 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  44.4 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  47.15 
 
 		 497 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  45.82 
 
 		 491 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  47.15 
 
 		 497 aa  363  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  44.83 
 
 		 494 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  46.57 
 
 		 491 aa  362  8e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  45.77 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  47.72 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  46.03 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  45.4 
 
 		 500 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  42.07 
 
 		 493 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  45.63 
 
 		 502 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  44.94 
 
 		 472 aa  355  7.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  47.46 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  41.5 
 
 		 488 aa  348  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  44.37 
 
 		 483 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  42.49 
 
 		 488 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  45.84 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  44.35 
 
 		 491 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  42.49 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  42.07 
 
 		 488 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  42.53 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  43.71 
 
 		 488 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  43.59 
 
 		 517 aa  346  6e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  42.07 
 
 		 488 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  42.07 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  42.07 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  42.01 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  43.21 
 
 		 480 aa  342  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  41.65 
 
 		 488 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  41.67 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  41.07 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  44.13 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  43.81 
 
 		 491 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  43.94 
 
 		 487 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  40.73 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  40.46 
 
 		 490 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  43.79 
 
 		 494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  39.25 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  43.51 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  40.59 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  41.51 
 
 		 507 aa  316  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  41.29 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  44.06 
 
 		 499 aa  302  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  38.52 
 
 		 506 aa  300  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  38.11 
 
 		 464 aa  286  7e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  40.43 
 
 		 492 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  37.34 
 
 		 486 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  37.42 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  37.42 
 
 		 540 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  36.7 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  36.7 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  36.49 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  36.99 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  36.7 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  36.49 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  37.04 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  36.49 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  35.76 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  35.76 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  35.76 
 
 		 484 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  36.49 
 
 		 478 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  34.78 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  36.08 
 
 		 478 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  34.58 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  34.58 
 
 		 480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  34.58 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  34.37 
 
 		 480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  39.43 
 
 		 525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  36.16 
 
 		 473 aa  254  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  39.39 
 
 		 525 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  39.39 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  39.39 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>