225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15540 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  902    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  54.74 
 
 		 481 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  53.96 
 
 		 491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  54.53 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  54.53 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  54.56 
 
 		 494 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  55.42 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  55.65 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  50.92 
 
 		 497 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  54.72 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  52.99 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  53.86 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  55.79 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  54.07 
 
 		 481 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  53.02 
 
 		 498 aa  435  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  48.17 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  48.4 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  47.57 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  48.17 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  51.04 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  51.83 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  46.48 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  47.81 
 
 		 494 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  46.88 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  47.25 
 
 		 500 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  46.61 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  47.84 
 
 		 485 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  47.3 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  47.06 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  46.79 
 
 		 491 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  47.13 
 
 		 491 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  45.89 
 
 		 492 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  47.15 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  48.15 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  44.4 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  45.13 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  47.55 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  46.91 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  48.1 
 
 		 472 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  44.16 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  46.64 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  47.49 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  47.63 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  44.37 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  46.23 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  43.51 
 
 		 488 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  44.37 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  45.45 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  47.18 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  45.42 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  43.94 
 
 		 488 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  43.51 
 
 		 488 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  44.14 
 
 		 517 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  43.94 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  43.94 
 
 		 488 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  42.01 
 
 		 484 aa  362  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  46.97 
 
 		 491 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  42.83 
 
 		 490 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  43.51 
 
 		 488 aa  360  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  44.37 
 
 		 488 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  43.57 
 
 		 492 aa  358  8e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  42.42 
 
 		 507 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  47.19 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  42.12 
 
 		 484 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  42.68 
 
 		 485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  42.83 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  45.13 
 
 		 491 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  46.07 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  42.21 
 
 		 507 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  47.26 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  39.68 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  41.32 
 
 		 506 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  38.65 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  37.34 
 
 		 483 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  36.16 
 
 		 483 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  36.16 
 
 		 487 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  38.46 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  37.5 
 
 		 486 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  38.38 
 
 		 492 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  37.74 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  37.95 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  35.87 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  35.87 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  35.87 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  37.1 
 
 		 480 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  37.23 
 
 		 529 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  37.74 
 
 		 480 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  37.74 
 
 		 480 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  37.42 
 
 		 529 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  33.54 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  37.06 
 
 		 486 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  40.48 
 
 		 500 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  37.55 
 
 		 503 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  35.82 
 
 		 486 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  40.25 
 
 		 525 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  37.28 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  38.95 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  40.25 
 
 		 525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  40.25 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  40.25 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>