225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4238 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1047    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  56.2 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  46.88 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  46.47 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  46.12 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  46.88 
 
 		 481 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  46.32 
 
 		 488 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  45.51 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  45.72 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  46.88 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  47.21 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  45.73 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  45.73 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  45.73 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  46.12 
 
 		 507 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  45.73 
 
 		 488 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  45.85 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  46.18 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  46.12 
 
 		 491 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  46.09 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  46.12 
 
 		 488 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  45.53 
 
 		 488 aa  435  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  45.19 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  45.92 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  45.92 
 
 		 488 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  44.71 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  45.33 
 
 		 488 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  44.66 
 
 		 500 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  44.09 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  44.99 
 
 		 492 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  44.99 
 
 		 497 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  44.9 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  44.07 
 
 		 494 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  46.92 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  43.14 
 
 		 502 aa  425  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  46.32 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  44.97 
 
 		 517 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  44.83 
 
 		 494 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  45.36 
 
 		 491 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  44.49 
 
 		 493 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  43.95 
 
 		 497 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  44.42 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  44.71 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  45.58 
 
 		 493 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  43.75 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  43.45 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  46.55 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  46.55 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  43.08 
 
 		 491 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  42.16 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  43.84 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  44.06 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  42.91 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  43.11 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  43.06 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  43.37 
 
 		 490 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  43.17 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  42.35 
 
 		 499 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  45.13 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  41.13 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  40.56 
 
 		 485 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  43.6 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  42.5 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  43.44 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  43.44 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  41.8 
 
 		 491 aa  362  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  38.68 
 
 		 506 aa  359  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  41.62 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  39.68 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  39.96 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  42.29 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  39.25 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  39.17 
 
 		 498 aa  318  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  35.7 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  36.92 
 
 		 500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  36.14 
 
 		 524 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  35.61 
 
 		 494 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  35.57 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  33.53 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  33.53 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  33.53 
 
 		 484 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2935  protein of unknown function UPF0061  34.97 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  33.46 
 
 		 488 aa  285  9e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  34.83 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  34.98 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  34.12 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  34.78 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  34.9 
 
 		 484 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  33.95 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  33.95 
 
 		 478 aa  281  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3841  hypothetical protein  34.52 
 
 		 484 aa  280  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.261021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  33.74 
 
 		 478 aa  279  9e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  33.74 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  33.95 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  33.54 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  33.95 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  32.59 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  35.43 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  33.74 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  33.74 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>