226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_A0019 on replicon NC_007483
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1066    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  98.62 
 
 
507 aa  1050    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  58.84 
 
 
492 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  57.2 
 
 
491 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  58.63 
 
 
491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  57.64 
 
 
483 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  55.17 
 
 
488 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  56.38 
 
 
488 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  55.56 
 
 
488 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  55.56 
 
 
488 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  55.97 
 
 
488 aa  568  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  57.47 
 
 
491 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  55.97 
 
 
488 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  55.76 
 
 
488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  55.56 
 
 
488 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  55.35 
 
 
488 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  55.35 
 
 
488 aa  561  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  55.56 
 
 
485 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  52.42 
 
 
517 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  54.18 
 
 
500 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  53.29 
 
 
500 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  53.72 
 
 
490 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  52.76 
 
 
491 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  52.05 
 
 
491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  51.85 
 
 
492 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  53.72 
 
 
490 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  51.42 
 
 
498 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  52.93 
 
 
484 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  52.37 
 
 
491 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  51.6 
 
 
502 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  51.65 
 
 
505 aa  495  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  52.61 
 
 
472 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  51.11 
 
 
497 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  48.57 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  51.12 
 
 
497 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  50.72 
 
 
493 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  50 
 
 
483 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  53.06 
 
 
491 aa  485  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  50.93 
 
 
480 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  53.06 
 
 
491 aa  485  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  49.79 
 
 
491 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  49.38 
 
 
484 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  50.82 
 
 
491 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  50.72 
 
 
505 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  50.2 
 
 
494 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  48.58 
 
 
493 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  51.95 
 
 
481 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  48.36 
 
 
492 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  50.2 
 
 
494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  50 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  50.51 
 
 
481 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  48.89 
 
 
500 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  49.79 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  51.33 
 
 
481 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  47.74 
 
 
485 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  47.25 
 
 
497 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  46.12 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  49.79 
 
 
512 aa  443  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  48.66 
 
 
487 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  50.32 
 
 
482 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  49.68 
 
 
485 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  48.63 
 
 
494 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  47.88 
 
 
491 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  46 
 
 
499 aa  426  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  48.38 
 
 
481 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  48.16 
 
 
481 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  48.38 
 
 
481 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  43.6 
 
 
464 aa  404  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  46.65 
 
 
486 aa  400  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  42.51 
 
 
506 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  42.66 
 
 
498 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  42.8 
 
 
492 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  42.42 
 
 
459 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  40.66 
 
 
483 aa  335  9e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  38.54 
 
 
480 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  40.93 
 
 
500 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  37.94 
 
 
487 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  40.25 
 
 
483 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  37.94 
 
 
483 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  39.07 
 
 
507 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  39.26 
 
 
522 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  39.82 
 
 
478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  40.13 
 
 
478 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  40.13 
 
 
478 aa  327  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  39.22 
 
 
480 aa  326  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  39.82 
 
 
478 aa  326  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  38.84 
 
 
540 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  37.32 
 
 
486 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  40.04 
 
 
478 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  40.13 
 
 
478 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.4 
 
 
486 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  39.82 
 
 
478 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  38.57 
 
 
522 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  38.84 
 
 
522 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  39.61 
 
 
478 aa  324  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  38.57 
 
 
522 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  38.57 
 
 
522 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  36.53 
 
 
540 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  38.18 
 
 
505 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  36.91 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>