225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2755 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  56.71 
 
 		 481 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  56.91 
 
 		 481 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  56.19 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  56.19 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  52.76 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  55.49 
 
 		 481 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  54.16 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  54.33 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  53.91 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  54.68 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  52.32 
 
 		 517 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  52.64 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  52.83 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  53.25 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  51.43 
 
 		 493 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  51.02 
 
 		 492 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  51.53 
 
 		 491 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  53.25 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  51.32 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  50.51 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  52.91 
 
 		 497 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  52.71 
 
 		 497 aa  475  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  52.54 
 
 		 485 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  50.71 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  52.34 
 
 		 485 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  50.92 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  51.22 
 
 		 502 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  54.23 
 
 		 486 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  51.72 
 
 		 491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  50.81 
 
 		 491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  49.39 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  48.98 
 
 		 488 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  50 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  49.9 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  51.73 
 
 		 482 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  52.54 
 
 		 481 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  48.98 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  52.54 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  52.54 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  48.88 
 
 		 488 aa  465  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  48.37 
 
 		 488 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  48.58 
 
 		 488 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  49.09 
 
 		 505 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  48.37 
 
 		 488 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  48.37 
 
 		 488 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  48.37 
 
 		 492 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  48.17 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  52.86 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  48.17 
 
 		 488 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  47.99 
 
 		 491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  50 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  50.92 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  47.25 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  49.7 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  48.78 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  51.5 
 
 		 481 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  50.31 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  47.05 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  48.98 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  48.68 
 
 		 480 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  46.64 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  46.44 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  48.98 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  44.62 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  45.66 
 
 		 484 aa  425  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  48.11 
 
 		 498 aa  425  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  47.37 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  43 
 
 		 484 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  48.64 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  48.83 
 
 		 499 aa  389  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  44.05 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  43.66 
 
 		 506 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  41.87 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  41.87 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  41.87 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  41.75 
 
 		 500 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0585  hypothetical protein  40.83 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  38.86 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.84 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  39.26 
 
 		 540 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  39.26 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.92 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  40.73 
 
 		 529 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  41.7 
 
 		 505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  40.69 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  39.92 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  39.71 
 
 		 488 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1456  hypothetical protein  40.53 
 
 		 529 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0629194  hitchhiker  0.0000911668 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  39.6 
 
 		 464 aa  322  8e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  40.61 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  38.76 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  38.38 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  40.08 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  38.38 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  39.12 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  39.49 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  40.08 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  40.08 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  40.08 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>