226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4843 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  100 
 
 		 502 aa  1001    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  66.87 
 
 		 491 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  79.71 
 
 		 491 aa  753    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  67.83 
 
 		 492 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  72.27 
 
 		 497 aa  689    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  67.07 
 
 		 492 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  69.04 
 
 		 491 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  68.9 
 
 		 492 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  70.53 
 
 		 491 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  71.93 
 
 		 491 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  71.86 
 
 		 497 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  71.26 
 
 		 498 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  65.04 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  61.74 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  62.22 
 
 		 500 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  62.42 
 
 		 500 aa  598  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  61.57 
 
 		 505 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  57.57 
 
 		 517 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  60.37 
 
 		 494 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  55.35 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  58.66 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  58 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  53.5 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  53.5 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  54.73 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  58.61 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  57.41 
 
 		 491 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  57.82 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  53.09 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  53.83 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  52.06 
 
 		 488 aa  521  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  52.06 
 
 		 488 aa  522  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  52.26 
 
 		 488 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  57.49 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  57.49 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  51.85 
 
 		 488 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  58.74 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  52.47 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  51.65 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  51.65 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  53.27 
 
 		 493 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  58.33 
 
 		 481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  53.16 
 
 		 493 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  54.12 
 
 		 485 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  56.3 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  51.6 
 
 		 507 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  55.78 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  55.04 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  54.49 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  54.58 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  54.58 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  51.6 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  53.97 
 
 		 481 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  54.51 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  49.39 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  52.82 
 
 		 494 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  54.87 
 
 		 500 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  48.88 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  51.33 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  54.78 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  51.72 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  48.88 
 
 		 490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  51.22 
 
 		 497 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  49.49 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  48.07 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  52.95 
 
 		 486 aa  444  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  50.82 
 
 		 487 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  43.14 
 
 		 501 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  46.64 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  51.15 
 
 		 498 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  44.74 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  46.12 
 
 		 498 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  46.2 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  46.2 
 
 		 522 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  46.2 
 
 		 540 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  46.34 
 
 		 522 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  46.2 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  45.96 
 
 		 522 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  46.47 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  45.76 
 
 		 522 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  46.26 
 
 		 507 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  44.55 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  44.55 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  45.17 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  44.55 
 
 		 525 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  45.02 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  44.98 
 
 		 525 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  44.03 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  43.78 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  44.55 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  45.54 
 
 		 521 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  43.64 
 
 		 487 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  45.86 
 
 		 497 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  44.55 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  46.6 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  42.99 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  44.36 
 
 		 521 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  42.54 
 
 		 486 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  44.97 
 
 		 483 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  42.66 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>