225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3122 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1045    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  46.56 
 
 		 491 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  46.56 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  44.13 
 
 		 488 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  43.66 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  43.32 
 
 		 488 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  42.89 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  43.29 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  43.09 
 
 		 488 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  42.89 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  44.74 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  43.61 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  43.29 
 
 		 488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  43.69 
 
 		 488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  44.35 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  44.94 
 
 		 491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  42.51 
 
 		 488 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  44.24 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  43.66 
 
 		 491 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  43.25 
 
 		 500 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  44.33 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  44.29 
 
 		 491 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  43.12 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  44.62 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  43.98 
 
 		 505 aa  395  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  45.88 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  42.51 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  44.65 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  45.78 
 
 		 497 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  44.4 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  44.05 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  42.31 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  41.33 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  45.11 
 
 		 498 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  43.12 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  43 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  46.12 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  43.86 
 
 		 491 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  42.91 
 
 		 517 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  44.94 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  46.12 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  46.12 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  44.28 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  42.97 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  45.57 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  45.56 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  42.24 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  44.95 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  43.6 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  45.28 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  45.28 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  43.8 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  42.57 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  43.45 
 
 		 485 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  41.84 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  44.24 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  42.69 
 
 		 483 aa  361  1e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  43.66 
 
 		 497 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  42.2 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  41.7 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  38.68 
 
 		 501 aa  357  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  39.4 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  40.61 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  45.19 
 
 		 486 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  39.76 
 
 		 490 aa  346  4e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  40.28 
 
 		 485 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  41.83 
 
 		 487 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  41.65 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  41.6 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  40.94 
 
 		 499 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  41.32 
 
 		 459 aa  322  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  39.28 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  38.52 
 
 		 475 aa  300  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  36.53 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  37.93 
 
 		 488 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  35.99 
 
 		 499 aa  289  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1842  hypothetical protein  39.55 
 
 		 503 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  38.21 
 
 		 500 aa  286  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  36.59 
 
 		 486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  36.59 
 
 		 540 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0971  hypothetical protein  39.19 
 
 		 488 aa  281  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  36.14 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  36.61 
 
 		 497 aa  279  9e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  37.73 
 
 		 496 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  33.73 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  36.46 
 
 		 483 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  35.26 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  35.26 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  35.26 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  39.11 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  35.92 
 
 		 478 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  37.29 
 
 		 518 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  35.88 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  35.88 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1510  hypothetical protein  36.58 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  35.67 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  38.94 
 
 		 496 aa  271  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  38.84 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  35.88 
 
 		 478 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>