225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1045 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  995    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  63.04 
 
 
491 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  59.84 
 
 
492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  60.66 
 
 
491 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  60.44 
 
 
498 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  65.16 
 
 
499 aa  567  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  60.37 
 
 
502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  57.79 
 
 
492 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  59.88 
 
 
497 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  59.68 
 
 
497 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  58.81 
 
 
491 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  59.96 
 
 
494 aa  548  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  59.96 
 
 
491 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  57.17 
 
 
500 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  57.17 
 
 
491 aa  543  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  56.97 
 
 
500 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  57.38 
 
 
492 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  55.1 
 
 
517 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  54.67 
 
 
505 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  55.44 
 
 
481 aa  514  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  53.47 
 
 
492 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  54.73 
 
 
505 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  50.71 
 
 
491 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  53.17 
 
 
483 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  50.62 
 
 
493 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  55.21 
 
 
491 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  54.19 
 
 
480 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  50.61 
 
 
491 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  50.2 
 
 
507 aa  477  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  54.3 
 
 
481 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  52.46 
 
 
485 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  53.69 
 
 
481 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  48.16 
 
 
488 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  53.48 
 
 
481 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  48.36 
 
 
488 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  48.88 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  49.08 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  49.08 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  54 
 
 
491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  48.88 
 
 
488 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  54 
 
 
491 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  48.36 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  48.16 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  47.95 
 
 
488 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  47.75 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  54.73 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  50.2 
 
 
507 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  54.85 
 
 
492 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  52.46 
 
 
472 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  48.56 
 
 
493 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  50.72 
 
 
483 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  51.38 
 
 
500 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  50 
 
 
497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  50.41 
 
 
512 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  46.52 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  46.52 
 
 
490 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  46.23 
 
 
484 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  46.72 
 
 
484 aa  438  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  44.47 
 
 
501 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  47.15 
 
 
485 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  48.26 
 
 
488 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  48.88 
 
 
487 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  48.68 
 
 
494 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  49.36 
 
 
482 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  47.84 
 
 
481 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  47.84 
 
 
481 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  46.51 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  47.84 
 
 
481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  46.51 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  47.55 
 
 
491 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  48.72 
 
 
485 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  52.04 
 
 
486 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  47.03 
 
 
522 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  46.17 
 
 
518 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  46.93 
 
 
522 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  47.03 
 
 
522 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  47.89 
 
 
500 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  45.25 
 
 
505 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1396  hypothetical protein  47.18 
 
 
520 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  45.66 
 
 
518 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  48.36 
 
 
522 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  47.01 
 
 
525 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1748  hypothetical protein  47.42 
 
 
525 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735869  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  47 
 
 
525 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  47.01 
 
 
521 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  45.88 
 
 
480 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  47.01 
 
 
525 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  45.67 
 
 
483 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  47.01 
 
 
525 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  47.01 
 
 
521 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  47.24 
 
 
540 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  46.41 
 
 
483 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  46.81 
 
 
521 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  46.72 
 
 
522 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  46.52 
 
 
522 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  45.55 
 
 
483 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2140  hypothetical protein  46.81 
 
 
521 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1497  hypothetical protein  44.93 
 
 
529 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0834231  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  45.67 
 
 
483 aa  378  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  43.1 
 
 
484 aa  378  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>