225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1567 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  1008    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  55.4 
 
 		 501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  49.38 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  49.49 
 
 		 500 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  50.1 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  48.99 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  49.39 
 
 		 492 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  47.93 
 
 		 491 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  48.36 
 
 		 500 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  48.97 
 
 		 507 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  47.92 
 
 		 488 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  48.23 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  47.71 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  48.12 
 
 		 488 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  48.36 
 
 		 492 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  47.92 
 
 		 488 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  47.92 
 
 		 488 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  47.92 
 
 		 488 aa  458  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  47.17 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  47.92 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  50.52 
 
 		 491 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  47.71 
 
 		 488 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  47.62 
 
 		 492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  47.57 
 
 		 497 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  47.62 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  49.59 
 
 		 494 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  48.07 
 
 		 502 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  47.92 
 
 		 491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  47.76 
 
 		 483 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  47.29 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  47.17 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  47.95 
 
 		 491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  48.24 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  48.26 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  47.75 
 
 		 492 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  47.35 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  46.72 
 
 		 494 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  46.53 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  46.77 
 
 		 481 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  47.15 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  46.77 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  46.94 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  45.25 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  46.63 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  45.04 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  46.19 
 
 		 480 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  45.89 
 
 		 500 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  46.01 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  46.01 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  43.65 
 
 		 493 aa  413  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  43.53 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  46.3 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  46.67 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  46.25 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  45.85 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  43 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  44.56 
 
 		 493 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  45.06 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  43.58 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  43.09 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  46.24 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  43.95 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  44.18 
 
 		 481 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  43.87 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  43.97 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  44.18 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  44.18 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  42.12 
 
 		 459 aa  355  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  39.4 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  44.21 
 
 		 486 aa  352  1e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  40.95 
 
 		 464 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  40.73 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  40.83 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  36.73 
 
 		 492 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  37.35 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  36.92 
 
 		 483 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2639  hypothetical protein  39.08 
 
 		 524 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  36.73 
 
 		 522 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  35.98 
 
 		 487 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  35.98 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  35.71 
 
 		 486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00396  hypothetical protein  38.12 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  35.85 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  36.62 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  36.82 
 
 		 518 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  35.9 
 
 		 486 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  35.53 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  35.53 
 
 		 478 aa  299  7e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  35.43 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4038  hypothetical protein  36.97 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  35.17 
 
 		 486 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  35.53 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  35.43 
 
 		 478 aa  299  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  36.51 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  35.53 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  34.97 
 
 		 540 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  35.63 
 
 		 480 aa  296  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  35.22 
 
 		 478 aa  296  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  35.17 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  36.13 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>