226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0823 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  75.66 
 
 
493 aa  780    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1020    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  58.02 
 
 
491 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  58.02 
 
 
491 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  55.71 
 
 
500 aa  537  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  54.71 
 
 
500 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  55.74 
 
 
481 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  55.94 
 
 
481 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  54.69 
 
 
485 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  52.44 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  54.19 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  55.56 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  52.03 
 
 
488 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  52.42 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  51.83 
 
 
488 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  52.33 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  51.83 
 
 
488 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  52.03 
 
 
488 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  52.24 
 
 
488 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  51.63 
 
 
488 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  53.16 
 
 
502 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  52.13 
 
 
492 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  51 
 
 
488 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  53.81 
 
 
491 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  51.61 
 
 
491 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  52.34 
 
 
512 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  53.33 
 
 
497 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  52.04 
 
 
492 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  53.33 
 
 
497 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  52.25 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  53.13 
 
 
498 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  55.31 
 
 
491 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  51.43 
 
 
497 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  51.11 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  52.03 
 
 
491 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  52.94 
 
 
481 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  51.96 
 
 
517 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  52.57 
 
 
483 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  52.97 
 
 
505 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  53.24 
 
 
494 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  48.79 
 
 
492 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  52.24 
 
 
492 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  51.53 
 
 
491 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  50.72 
 
 
491 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  48.58 
 
 
507 aa  474  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  51.53 
 
 
505 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  52.14 
 
 
491 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  49.28 
 
 
484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  50.82 
 
 
483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  51.74 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  52.06 
 
 
480 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  51.94 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  51.94 
 
 
481 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  48.58 
 
 
507 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  50.82 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  51.23 
 
 
487 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  48.56 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  48.1 
 
 
490 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  48.4 
 
 
490 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  50.72 
 
 
471 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  50 
 
 
482 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  50 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  48.89 
 
 
485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  48.16 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  48.98 
 
 
486 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  45.58 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  46.44 
 
 
499 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  44.56 
 
 
484 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  46.88 
 
 
498 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  46.48 
 
 
459 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  44.05 
 
 
506 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  42.53 
 
 
492 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  41.07 
 
 
464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  42.07 
 
 
475 aa  355  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  42.42 
 
 
478 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  42.42 
 
 
478 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  42.21 
 
 
478 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  42.42 
 
 
478 aa  348  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  42.21 
 
 
478 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  41.99 
 
 
478 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  41.07 
 
 
483 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  41.99 
 
 
478 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  42.42 
 
 
478 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0017  protein of unknown function UPF0061  41.3 
 
 
500 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.394227  normal  0.227022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  42.24 
 
 
480 aa  345  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  41.56 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  42.08 
 
 
497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  39.83 
 
 
486 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  42.77 
 
 
525 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  42.77 
 
 
521 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2336  hypothetical protein  42.77 
 
 
521 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  40.19 
 
 
522 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1204  hypothetical protein  42.56 
 
 
525 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  42.56 
 
 
525 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  40.16 
 
 
540 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  42.59 
 
 
483 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  40.16 
 
 
522 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1931  hypothetical protein  42.56 
 
 
525 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  42.56 
 
 
521 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  39.63 
 
 
540 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>