225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5582 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  65.98 
 
 
491 aa  645    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  68.39 
 
 
485 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  98.96 
 
 
481 aa  951    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  73.33 
 
 
512 aa  699    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  98.96 
 
 
481 aa  951    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  68.61 
 
 
482 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  69.28 
 
 
494 aa  678    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  964    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1790  protein of unknown function UPF0061  69.23 
 
 
486 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20050  hypothetical protein  58.54 
 
 
498 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  58.59 
 
 
481 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  57.58 
 
 
491 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  57.58 
 
 
491 aa  521  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  58.18 
 
 
481 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  55.89 
 
 
494 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  56.94 
 
 
481 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  57 
 
 
498 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  57.11 
 
 
491 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  58.35 
 
 
497 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  58.35 
 
 
497 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  53.97 
 
 
502 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  53.85 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  54.86 
 
 
491 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  56.96 
 
 
492 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  55.28 
 
 
491 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  51.95 
 
 
493 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  53.67 
 
 
505 aa  484  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  55.6 
 
 
491 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  55.48 
 
 
492 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  54.95 
 
 
459 aa  475  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  53.67 
 
 
492 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  51.74 
 
 
493 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  52.14 
 
 
491 aa  473  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2755  hypothetical protein  52.54 
 
 
497 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1318  hypothetical protein  54.69 
 
 
485 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  55.05 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  53.22 
 
 
500 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  54.31 
 
 
491 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0596  hypothetical protein  52.26 
 
 
517 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  53.77 
 
 
491 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  53.16 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3508  hypothetical protein  48.97 
 
 
488 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3221  hypothetical protein  49.07 
 
 
488 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0963189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  51.74 
 
 
505 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3522  hypothetical protein  49.08 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.202942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3307  hypothetical protein  48.15 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3222  hypothetical protein  48.35 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3523  hypothetical protein  48.15 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.766796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2160  protein of unknown function UPF0061  50.92 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000219883  normal  0.028936 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3567  hypothetical protein  48.15 
 
 
488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3529  hypothetical protein  48.56 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1740  hypothetical protein  48.35 
 
 
488 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0492514 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3274  hypothetical protein  47.94 
 
 
488 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.456821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  50.31 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  47.74 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4058  hypothetical protein  50.62 
 
 
471 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0997  hypothetical protein  46.52 
 
 
484 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00113309  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0019  hypothetical protein  48.16 
 
 
507 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  50.1 
 
 
487 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0040  hypothetical protein  48.39 
 
 
490 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0691  hypothetical protein  46.83 
 
 
507 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  48.67 
 
 
494 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31570  hypothetical protein  50.41 
 
 
475 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  49.48 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0041  hypothetical protein  47.63 
 
 
490 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  50.75 
 
 
483 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1802  hypothetical protein  48.35 
 
 
480 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.322883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0310  hypothetical protein  50.84 
 
 
499 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  44.35 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  46.12 
 
 
506 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  43.6 
 
 
501 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  44.18 
 
 
484 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1826  hypothetical protein  43 
 
 
522 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.469331  normal  0.512842 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  42.89 
 
 
464 aa  348  1e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  40.61 
 
 
486 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  40.2 
 
 
486 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1896  hypothetical protein  42.8 
 
 
522 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1366  hypothetical protein  43.49 
 
 
522 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.389221  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1026  hypothetical protein  42.42 
 
 
505 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.260579  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  41.5 
 
 
488 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  40.41 
 
 
540 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5209  hypothetical protein  43.07 
 
 
540 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1768  hypothetical protein  42.97 
 
 
507 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0126151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6171  hypothetical protein  43.07 
 
 
522 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1908  hypothetical protein  43.07 
 
 
522 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1931  hypothetical protein  43.07 
 
 
522 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0356725  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  40.29 
 
 
486 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1924  hypothetical protein  43.15 
 
 
518 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.064946  normal  0.732324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1192  protein of unknown function UPF0061  44.15 
 
 
492 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2947  hypothetical protein  43.68 
 
 
498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2297  hypothetical protein  41.56 
 
 
525 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2457  hypothetical protein  41.56 
 
 
521 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  41.31 
 
 
480 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  41.31 
 
 
480 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  41.31 
 
 
480 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2276  hypothetical protein  43.13 
 
 
518 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391464  normal  0.115261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  42.57 
 
 
497 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1440  hypothetical protein  41.36 
 
 
525 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1677  hypothetical protein  43.86 
 
 
495 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3374  hypothetical protein  41.36 
 
 
521 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>