225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0940 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  957    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  60.55 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  54.74 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  54.49 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  54.53 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  52.43 
 
 		 498 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  52.43 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  52.65 
 
 		 475 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  50.42 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  49.13 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  41.76 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  40.48 
 
 		 473 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  40.48 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  42.32 
 
 		 492 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  41.01 
 
 		 475 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  40.26 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  38.85 
 
 		 485 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  42.79 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  38.11 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  45.74 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  38.05 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  37.74 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  38.1 
 
 		 494 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  38.01 
 
 		 486 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  37.42 
 
 		 540 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  32.51 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  32.51 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  32.51 
 
 		 484 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  38.41 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  35 
 
 		 484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  40.14 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0926  hypothetical protein  36.34 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  34.8 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  39.7 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  37.61 
 
 		 491 aa  193  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  37.61 
 
 		 491 aa  193  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  32.15 
 
 		 491 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  40.89 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  35.97 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5760  hypothetical protein  39.02 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  34.73 
 
 		 473 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  39.56 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66410  hypothetical protein  37.88 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  41.46 
 
 		 492 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  41.8 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  35.54 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0262  hypothetical protein  36.6 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0540554  normal  0.0168688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0558  hypothetical protein  37.26 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  32.66 
 
 		 493 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  33.63 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0716  protein of unknown function UPF0061  38 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3122  hypothetical protein  38.71 
 
 		 506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0407  hypothetical protein  40.46 
 
 		 493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  35.92 
 
 		 483 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  31.45 
 
 		 459 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  34.49 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2521  hypothetical protein  37.41 
 
 		 483 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  33.04 
 
 		 480 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  32.94 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  32.94 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2214  hypothetical protein  37.78 
 
 		 491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000439829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  36.99 
 
 		 494 aa  183  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  36.48 
 
 		 491 aa  183  6e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0494  hypothetical protein  34.91 
 
 		 487 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  38.55 
 
 		 500 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1157  protein of unknown function UPF0061  36.31 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5348  hypothetical protein  37.83 
 
 		 497 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  34.98 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  34.02 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4863  hypothetical protein  41.22 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2436  protein of unknown function UPF0061  36.73 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000535326  normal  0.0221167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  34.02 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  35.71 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  39.75 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  34.23 
 
 		 483 aa  181  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  34.56 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  38.3 
 
 		 494 aa  181  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  32.96 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  34.02 
 
 		 481 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  37.46 
 
 		 498 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  34.65 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4156  hypothetical protein  36.09 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  34.65 
 
 		 478 aa  179  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3645  hypothetical protein  37.25 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.348897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0330  hypothetical protein  37.25 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  34.65 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  35.1 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  37.35 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0297  hypothetical protein  37.55 
 
 		 492 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  34.5 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  34.98 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1564  hypothetical protein  36.22 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  31.42 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0299  hypothetical protein  37.25 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.281657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4038  hypothetical protein  36.09 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  34.45 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3961  protein of unknown function UPF0061  36.09 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>