225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4693 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4693  hypothetical protein  100 
 
 		 459 aa  924    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264866  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4180  hypothetical protein  92.37 
 
 		 498 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4628  hypothetical protein  72.25 
 
 		 475 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4549  hypothetical protein  93.03 
 
 		 498 aa  860    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0105062  normal  0.998456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0344  hypothetical protein  72.25 
 
 		 479 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1953  hypothetical protein  58.59 
 
 		 477 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4337  hypothetical protein  59.33 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1246  hypothetical protein  56.46 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.821043  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0940  hypothetical protein  54.53 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2305  hypothetical protein  54.2 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2574  hypothetical protein  43.27 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3532  hypothetical protein  43.27 
 
 		 473 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0868  hypothetical protein  43.36 
 
 		 475 aa  345  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.11828  decreased coverage  0.00000126503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1028  hypothetical protein  41.39 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4885  hypothetical protein  42.64 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1476  hypothetical protein  40.75 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.276999  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5064  hypothetical protein  40.65 
 
 		 482 aa  325  9e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2138  hypothetical protein  44.16 
 
 		 478 aa  318  2e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28081  hypothetical protein  41.99 
 
 		 493 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1584  hypothetical protein  42.48 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1520  hypothetical protein  39.23 
 
 		 508 aa  222  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2164  hypothetical protein  37.2 
 
 		 480 aa  220  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.649385  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01411  hypothetical protein  36.02 
 
 		 489 aa  219  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1567  hypothetical protein  35.43 
 
 		 484 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288237  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2120  hypothetical protein  37.22 
 
 		 473 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1631  hypothetical protein  34.53 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1659  hypothetical protein  37.22 
 
 		 483 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4941  hypothetical protein  40.75 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2463  hypothetical protein  31.28 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5068  hypothetical protein  40.75 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5118  hypothetical protein  40.75 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1840  hypothetical protein  36.42 
 
 		 487 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1167  hypothetical protein  36.59 
 
 		 494 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0398  hypothetical protein  40.21 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3863  hypothetical protein  39.45 
 
 		 491 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1734  hypothetical protein  36.42 
 
 		 483 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2569  hypothetical protein  34.69 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000577129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2576  hypothetical protein  34.69 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00357647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2583  hypothetical protein  34.69 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.109639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1456  hypothetical protein  32.76 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2000  hypothetical protein  32.76 
 
 		 480 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.407713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004051  UPF0061 domain-containing protein  35.73 
 
 		 489 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.243743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1045  hypothetical protein  37.22 
 
 		 494 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432954 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1828  hypothetical protein  32.52 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1440  hypothetical protein  33.01 
 
 		 480 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1474  hypothetical protein  32.52 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1736  hypothetical protein  34.93 
 
 		 480 aa  203  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2765  hypothetical protein  38.04 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1059  hypothetical protein  38.26 
 
 		 485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4843  protein of unknown function UPF0061  37.26 
 
 		 502 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287354  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2495  hypothetical protein  38.54 
 
 		 492 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3269  hypothetical protein  35.26 
 
 		 483 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1484  hypothetical protein  34.49 
 
 		 478 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2948  hypothetical protein  38.22 
 
 		 492 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1035  hypothetical protein  39.58 
 
 		 481 aa  199  9e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.414237  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01675  hypothetical protein  32.55 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0763449  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2375  hypothetical protein  39.72 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1788  hypothetical protein  35.76 
 
 		 518 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01664  hypothetical protein  32.55 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.049992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2210  hypothetical protein  35.08 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0842577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1901  hypothetical protein  40.78 
 
 		 481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1936  protein of unknown function UPF0061  34.4 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1924  hypothetical protein  34.2 
 
 		 478 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0996685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0997  hypothetical protein  37.14 
 
 		 491 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1836  hypothetical protein  33.6 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2066  protein of unknown function UPF0061  41.2 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000546144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1786  hypothetical protein  34.11 
 
 		 478 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2495  hypothetical protein  39.18 
 
 		 494 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0945  hypothetical protein  36.36 
 
 		 505 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600857  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4892  hypothetical protein  33.1 
 
 		 491 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.856599  hitchhiker  0.00960553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0823  hypothetical protein  37.25 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1910  hypothetical protein  33.82 
 
 		 478 aa  192  9e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1925  hypothetical protein  33.82 
 
 		 478 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0857  hypothetical protein  35.24 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220495  normal  0.340098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45110  hypothetical protein  39.42 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479071  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0982  hypothetical protein  35.24 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2424  hypothetical protein  33.62 
 
 		 478 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5202  hypothetical protein  37.28 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5290  hypothetical protein  37.28 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1019  hypothetical protein  36.1 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5582  hypothetical protein  36.93 
 
 		 481 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0331562  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1512  protein of unknown function UPF0061  35.52 
 
 		 485 aa  190  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385999  normal  0.55294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2958  hypothetical protein  37.04 
 
 		 505 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15540  hypothetical protein  38.38 
 
 		 459 aa  190  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00170521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0677  protein of unknown function UPF0061  38.67 
 
 		 491 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.377469 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0519  hypothetical protein  38.67 
 
 		 491 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3434  protein of unknown function UPF0061  36.36 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5402  hypothetical protein  36.83 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0192  protein of unknown function UPF0061  35.96 
 
 		 500 aa  188  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.212573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3959  hypothetical protein  36.36 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.901643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4238  hypothetical protein  30.36 
 
 		 501 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.263052  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3632  protein of unknown function UPF0061  34.58 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3772  hypothetical protein  37.29 
 
 		 493 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2335  hypothetical protein  39.02 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.331723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5772  hypothetical protein  38.81 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.927305  decreased coverage  0.00684565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3454  hypothetical protein  40 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2581  hypothetical protein  34.23 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0720636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3302  hypothetical protein  37.06 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2395  hypothetical protein  32.11 
 
 		 496 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4049  hypothetical protein  37.58 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>