More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2504 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2504  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0380502  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0601  Methyltransferase type 11  44.62 
 
 
268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06070  hypothetical protein  32.56 
 
 
226 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.76 
 
 
283 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  27.06 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  27.06 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.04 
 
 
273 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  22.47 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.2 
 
 
776 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.17 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  25 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3929  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 
269 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  35.09 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  27.64 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  27.64 
 
 
226 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  27.64 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  28.91 
 
 
342 aa  58.9  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.83 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.07 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.04 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.83 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  26.83 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  34.21 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.02 
 
 
236 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  35.35 
 
 
280 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  27.4 
 
 
271 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  33.63 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.02 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  30 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  26.02 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  25.14 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  22.77 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2831  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.12 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  28.97 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.7 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.26 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.26 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  30.7 
 
 
310 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
204 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  25.5 
 
 
275 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  30.7 
 
 
311 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
204 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
415 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  26.53 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
211 aa  52.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  30.4 
 
 
242 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
270 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
382 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 
258 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  26.9 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 
251 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  27.17 
 
 
251 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0265  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2092  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.61 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.05447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.2 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  29.41 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  23.68 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.47 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.24 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>