179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3488 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 720 aa  1439    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  45.93 
 
 		 531 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  45.73 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  44.86 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  44.47 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  44.35 
 
 		 597 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  44.15 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  44.15 
 
 		 604 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  44.15 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  46.09 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  43.89 
 
 		 530 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  40.55 
 
 		 608 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  40.26 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  40.26 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  40.26 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  44.71 
 
 		 518 aa  353  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  42.75 
 
 		 537 aa  348  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  42.75 
 
 		 537 aa  348  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  40.92 
 
 		 587 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  45.04 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  43.02 
 
 		 532 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  41.12 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  44.22 
 
 		 519 aa  343  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  41.84 
 
 		 545 aa  340  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  41.36 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  46.22 
 
 		 529 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  43.85 
 
 		 534 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  39.39 
 
 		 526 aa  333  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  40.37 
 
 		 543 aa  332  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  43.41 
 
 		 524 aa  330  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  41.56 
 
 		 533 aa  327  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  41.81 
 
 		 534 aa  323  7e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  45.51 
 
 		 560 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  41.56 
 
 		 534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  45.51 
 
 		 507 aa  320  6e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  45.15 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  42.62 
 
 		 540 aa  311  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  39.84 
 
 		 534 aa  308  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  40.19 
 
 		 534 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  40.62 
 
 		 498 aa  302  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  40.87 
 
 		 537 aa  300  5e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  39.02 
 
 		 584 aa  297  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  40.7 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  40.7 
 
 		 540 aa  293  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  38.48 
 
 		 503 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.46 
 
 		 533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  38.37 
 
 		 588 aa  284  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.45 
 
 		 520 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.23 
 
 		 530 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  41.07 
 
 		 504 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  35.83 
 
 		 551 aa  279  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  42.73 
 
 		 528 aa  279  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  35.83 
 
 		 551 aa  279  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  37.96 
 
 		 539 aa  278  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  36.01 
 
 		 551 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  35.65 
 
 		 551 aa  277  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  38.39 
 
 		 539 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 		 542 aa  278  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  37.96 
 
 		 539 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  37.96 
 
 		 539 aa  277  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  38.76 
 
 		 495 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  42.03 
 
 		 545 aa  276  9e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.12 
 
 		 503 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  39.22 
 
 		 529 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  36.21 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  36.21 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  36.21 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  36.4 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 		 519 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  37.31 
 
 		 551 aa  275  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.19 
 
 		 541 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  38.39 
 
 		 539 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  41.71 
 
 		 579 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.91 
 
 		 545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.91 
 
 		 545 aa  271  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.69 
 
 		 545 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  41.71 
 
 		 559 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  38.63 
 
 		 543 aa  270  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.69 
 
 		 498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  40.59 
 
 		 559 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  38.85 
 
 		 498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.5 
 
 		 544 aa  268  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  37.74 
 
 		 551 aa  267  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  36.09 
 
 		 539 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  39 
 
 		 559 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  36.29 
 
 		 539 aa  266  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  40.65 
 
 		 532 aa  266  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  38.92 
 
 		 514 aa  264  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.95 
 
 		 540 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  37.37 
 
 		 528 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  37.37 
 
 		 511 aa  263  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  40.49 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3081  glucan biosynthesis protein G  38.99 
 
 		 558 aa  262  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188456  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.19 
 
 		 517 aa  261  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  39.19 
 
 		 511 aa  261  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  39.19 
 
 		 517 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>