174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3337 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  85.83 
 
 		 507 aa  856    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  97.32 
 
 		 560 aa  1053    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 560 aa  1118    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  62.71 
 
 		 534 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  62.85 
 
 		 525 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  60 
 
 		 534 aa  621  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  60.38 
 
 		 534 aa  611  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  59.45 
 
 		 534 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  59.67 
 
 		 537 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  56.9 
 
 		 530 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  54.29 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  54.29 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  56.04 
 
 		 594 aa  581  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  54.29 
 
 		 608 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  54.29 
 
 		 562 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  55.01 
 
 		 597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  54.83 
 
 		 604 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  54.64 
 
 		 604 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  54.64 
 
 		 558 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  55.38 
 
 		 568 aa  559  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  45.03 
 
 		 542 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  48.05 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  43.8 
 
 		 539 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  43.98 
 
 		 539 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  44.97 
 
 		 543 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  45.37 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  45.37 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  45.74 
 
 		 539 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  43.76 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  45.19 
 
 		 539 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  45.19 
 
 		 539 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  43.76 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  43.68 
 
 		 551 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  43.76 
 
 		 541 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  45.18 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  43.49 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  42.7 
 
 		 503 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  43.68 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  46.34 
 
 		 519 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  46.35 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  45.12 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  43.49 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  43.68 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  43.68 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  44.99 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  43.51 
 
 		 551 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  42.77 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  42.89 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  43.25 
 
 		 519 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  42.75 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  43.27 
 
 		 551 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  43.02 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  43.35 
 
 		 531 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  42.91 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  42.91 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  43.35 
 
 		 527 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  44.34 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  43.48 
 
 		 503 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  43.24 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  42.57 
 
 		 550 aa  379  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  43.77 
 
 		 526 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  44.04 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  42.35 
 
 		 534 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  43.31 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  43.06 
 
 		 530 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  42.02 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  43.26 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  43.03 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  40 
 
 		 522 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  44.06 
 
 		 528 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  43.94 
 
 		 542 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  43.45 
 
 		 532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  41.21 
 
 		 533 aa  357  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 		 545 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.48 
 
 		 545 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 		 498 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 		 545 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.48 
 
 		 544 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  45.81 
 
 		 529 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  42.35 
 
 		 511 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 		 533 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 		 517 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  41.33 
 
 		 519 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  39.41 
 
 		 525 aa  346  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  42.77 
 
 		 540 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  38.87 
 
 		 511 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  38.87 
 
 		 517 aa  346  8e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  38.87 
 
 		 511 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  40.42 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  39.22 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 517 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 511 aa  345  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>