174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3122 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  76.58 
 
 
541 aa  902    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  76.49 
 
 
539 aa  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  76.46 
 
 
551 aa  917    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  62.39 
 
 
539 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  62.39 
 
 
539 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  65.14 
 
 
542 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  76.68 
 
 
539 aa  901    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  76.68 
 
 
539 aa  901    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  78.29 
 
 
539 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  78.29 
 
 
539 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  59.23 
 
 
550 aa  689    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  78.66 
 
 
539 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  76.46 
 
 
551 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  76.95 
 
 
551 aa  927    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
551 aa  1150    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  76.64 
 
 
551 aa  920    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  76.64 
 
 
551 aa  919    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  78.11 
 
 
539 aa  915    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  78.48 
 
 
539 aa  921    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  76.68 
 
 
539 aa  901    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  47.93 
 
 
525 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  49.9 
 
 
534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  46.68 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  47.64 
 
 
534 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  44.44 
 
 
534 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  44.36 
 
 
537 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  43.51 
 
 
608 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  43.51 
 
 
562 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  43.51 
 
 
562 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  43.51 
 
 
562 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  46.21 
 
 
530 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  42.94 
 
 
594 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  44.8 
 
 
568 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  43.07 
 
 
597 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  42.61 
 
 
604 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  42.61 
 
 
604 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  42.94 
 
 
558 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  46.28 
 
 
507 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  44.34 
 
 
560 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  44.44 
 
 
560 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  41.56 
 
 
551 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  41.84 
 
 
587 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  41.67 
 
 
537 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  41.67 
 
 
537 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  37.78 
 
 
503 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  39.39 
 
 
498 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  39.49 
 
 
526 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
495 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  40.82 
 
 
524 aa  331  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  41.2 
 
 
518 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.72 
 
 
533 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  41.02 
 
 
545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  37.85 
 
 
503 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  39.86 
 
 
528 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.41 
 
 
546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  39.68 
 
 
519 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  40.43 
 
 
540 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  40.15 
 
 
519 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  38.35 
 
 
511 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  38.12 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  38.89 
 
 
504 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  37.4 
 
 
532 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
530 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
520 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  38.29 
 
 
584 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.38 
 
 
534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  36.16 
 
 
543 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  36.66 
 
 
545 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  38.13 
 
 
527 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  37.93 
 
 
531 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  36.47 
 
 
545 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  36.28 
 
 
545 aa  310  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  37.04 
 
 
498 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  37.4 
 
 
545 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  36.57 
 
 
542 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  36.57 
 
 
542 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  38.42 
 
 
514 aa  309  9e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  36.57 
 
 
542 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  36.57 
 
 
542 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  37.13 
 
 
540 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  37.9 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  37.4 
 
 
559 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  38.68 
 
 
522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 
527 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  35.81 
 
 
533 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  36.95 
 
 
522 aa  303  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  36.35 
 
 
519 aa  303  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
544 aa  302  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  37.5 
 
 
525 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  37.5 
 
 
525 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  34.57 
 
 
536 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  41.28 
 
 
529 aa  300  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  37.35 
 
 
543 aa  299  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  38.48 
 
 
522 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.6 
 
 
522 aa  299  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>