174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3043 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
534 aa  1100    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  51.96 
 
 
540 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  53.16 
 
 
540 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  53.16 
 
 
540 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  44.97 
 
 
498 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  44.63 
 
 
530 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  44.83 
 
 
520 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  45.23 
 
 
533 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  44.28 
 
 
588 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  42.54 
 
 
559 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  43.27 
 
 
525 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  43.6 
 
 
504 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  42.74 
 
 
568 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  42.36 
 
 
597 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  40.82 
 
 
546 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
562 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  42.36 
 
 
604 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  42.36 
 
 
604 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  42.36 
 
 
558 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
562 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  44.02 
 
 
519 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
608 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
562 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  42.71 
 
 
545 aa  392  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  40.48 
 
 
545 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  40.48 
 
 
545 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  40.48 
 
 
545 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  42.13 
 
 
534 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  41.68 
 
 
542 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  40.54 
 
 
594 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  41.68 
 
 
542 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  41.89 
 
 
542 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  41.89 
 
 
542 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  42.98 
 
 
528 aa  383  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.6 
 
 
544 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
498 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
522 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.71 
 
 
503 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  40.57 
 
 
525 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  40.86 
 
 
540 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  41.54 
 
 
579 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  40.57 
 
 
525 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  41.54 
 
 
559 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  39.81 
 
 
537 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  42.53 
 
 
514 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  39.81 
 
 
537 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  41.44 
 
 
495 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  40.59 
 
 
503 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.84 
 
 
517 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  40.92 
 
 
579 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  40.41 
 
 
527 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  38.33 
 
 
532 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  38.33 
 
 
532 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
517 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  42.35 
 
 
560 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  42.15 
 
 
560 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  40.95 
 
 
529 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
517 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
511 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  39.17 
 
 
642 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  42.57 
 
 
540 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 
526 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  40.12 
 
 
530 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  40.41 
 
 
527 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  40.39 
 
 
604 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  40.71 
 
 
559 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
533 aa  363  4e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  42.48 
 
 
518 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 
505 aa  361  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  38.09 
 
 
519 aa  361  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
517 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.63 
 
 
532 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
517 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
517 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  42.01 
 
 
542 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
517 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  40.61 
 
 
528 aa  360  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  39.62 
 
 
543 aa  360  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  41 
 
 
532 aa  359  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  39.47 
 
 
529 aa  359  9e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  38.96 
 
 
641 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
517 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  39.17 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  39.47 
 
 
529 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.62 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  39.84 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.62 
 
 
528 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  41.41 
 
 
534 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  39.43 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  39.63 
 
 
522 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  39.27 
 
 
531 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  42.28 
 
 
507 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  40.66 
 
 
536 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  39.74 
 
 
526 aa  354  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>