174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4673 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  80.37 
 
 		 537 aa  895    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  60.67 
 
 		 526 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  79.07 
 
 		 551 aa  884    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  61.78 
 
 		 545 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 540 aa  1105    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  65.96 
 
 		 587 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  66.67 
 
 		 519 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  68.59 
 
 		 524 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  80.37 
 
 		 537 aa  895    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  71.43 
 
 		 532 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  67.4 
 
 		 518 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  59.26 
 
 		 543 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  49.71 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  50.09 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  49.71 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  51.01 
 
 		 527 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  48.55 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  48.24 
 
 		 534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  48.71 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  47.02 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  48.44 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  45.69 
 
 		 537 aa  427  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  47.62 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  45.77 
 
 		 534 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  44.17 
 
 		 604 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  44.3 
 
 		 562 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  44.53 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  44.3 
 
 		 608 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  44.3 
 
 		 562 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  44.3 
 
 		 562 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  44.17 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  44.17 
 
 		 558 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  43.98 
 
 		 597 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  47.31 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  45.23 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  48.05 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  45.51 
 
 		 560 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  45.44 
 
 		 560 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  42.49 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  42 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  42.49 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  42.49 
 
 		 539 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  42.3 
 
 		 539 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  41.82 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  43.22 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  42.12 
 
 		 539 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  42.75 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  41.05 
 
 		 551 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  42.57 
 
 		 534 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  41.23 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  41.23 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  41.23 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  41.04 
 
 		 541 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  41.04 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  41.04 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  41.04 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  46.06 
 
 		 720 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  41.04 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  44.33 
 
 		 498 aa  362  9e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.17 
 
 		 504 aa  360  5e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  42 
 
 		 533 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.97 
 
 		 530 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.97 
 
 		 520 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  43.43 
 
 		 528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  42.45 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  42.74 
 
 		 542 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 		 551 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  40.19 
 
 		 588 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  42.2 
 
 		 519 aa  343  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.14 
 
 		 495 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.05 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  39.75 
 
 		 550 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  41.99 
 
 		 527 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  39.44 
 
 		 544 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  42.08 
 
 		 540 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 		 543 aa  329  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.25 
 
 		 545 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.06 
 
 		 545 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.25 
 
 		 545 aa  326  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 		 540 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.64 
 
 		 505 aa  326  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.25 
 
 		 498 aa  325  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  36.5 
 
 		 546 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  38.86 
 
 		 529 aa  323  7e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  36.63 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  36.63 
 
 		 542 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  37.9 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.85 
 
 		 525 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.85 
 
 		 525 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  36.45 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  36.45 
 
 		 542 aa  320  5e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 		 514 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  39.64 
 
 		 545 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  39.08 
 
 		 528 aa  319  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 		 540 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  39.08 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  38.25 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  39.28 
 
 		 539 aa  317  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>