174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4893 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  65.59 
 
 		 524 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  66.22 
 
 		 551 aa  708    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  66.79 
 
 		 537 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  65.35 
 
 		 540 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  67.34 
 
 		 587 aa  690    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  63.16 
 
 		 532 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  63.38 
 
 		 545 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  66.79 
 
 		 537 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 518 aa  1033    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  90.91 
 
 		 519 aa  925    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  61.71 
 
 		 526 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  55.7 
 
 		 543 aa  559  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  49.91 
 
 		 534 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  48.59 
 
 		 534 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  50.3 
 
 		 525 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  47.83 
 
 		 534 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  46.92 
 
 		 530 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  48.68 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  46.67 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  48.88 
 
 		 527 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  48.7 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  48.53 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  49.03 
 
 		 560 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  45.92 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  44.96 
 
 		 604 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  45.16 
 
 		 604 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  45.23 
 
 		 537 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  45.16 
 
 		 558 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  46.43 
 
 		 584 aa  411  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  45.68 
 
 		 534 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  44.38 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  45.09 
 
 		 594 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  44.12 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  48.05 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  44.12 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  44.12 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  44.12 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  48.43 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  42.64 
 
 		 533 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  41.1 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  43.32 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  41 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  42.48 
 
 		 534 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 		 588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  41.13 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  43.42 
 
 		 498 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  42.07 
 
 		 503 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  41.87 
 
 		 530 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  44.4 
 
 		 519 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  41.53 
 
 		 504 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  41.78 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  43.34 
 
 		 720 aa  351  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  44.29 
 
 		 542 aa  349  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  38.76 
 
 		 551 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  38.76 
 
 		 551 aa  346  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.2 
 
 		 495 aa  345  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  38.57 
 
 		 551 aa  345  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.43 
 
 		 541 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.43 
 
 		 539 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  40.38 
 
 		 539 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  38.57 
 
 		 551 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  40.38 
 
 		 539 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  40.38 
 
 		 539 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  39.43 
 
 		 539 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  39.43 
 
 		 539 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  39.43 
 
 		 539 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  40.19 
 
 		 539 aa  342  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  42.34 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  40.19 
 
 		 539 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 		 532 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  44.01 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  41.91 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  40.51 
 
 		 551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  40.19 
 
 		 514 aa  335  1e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  39.31 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  40.53 
 
 		 527 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  38.76 
 
 		 519 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.2 
 
 		 544 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  40.41 
 
 		 559 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  40.89 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  40.89 
 
 		 540 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  38.29 
 
 		 522 aa  321  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  38.03 
 
 		 550 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.89 
 
 		 545 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 		 545 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.49 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  41.63 
 
 		 545 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 		 545 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.49 
 
 		 545 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  41.51 
 
 		 559 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  40.61 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.51 
 
 		 498 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  37.06 
 
 		 525 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  37.06 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  38.45 
 
 		 533 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  35.93 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  35.93 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>