174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0579 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
584 aa  1205    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  49.6 
 
 
526 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  44.64 
 
 
543 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  44.39 
 
 
537 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  44.39 
 
 
537 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  43.4 
 
 
551 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  47.02 
 
 
540 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  46.43 
 
 
518 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  44.83 
 
 
532 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  47.25 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  43.91 
 
 
587 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  42.8 
 
 
545 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  44.77 
 
 
524 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  41.12 
 
 
531 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
527 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  42.22 
 
 
525 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  41.32 
 
 
527 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  40.26 
 
 
560 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  39.19 
 
 
539 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  39 
 
 
539 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  39 
 
 
539 aa  324  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  39 
 
 
539 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  38.22 
 
 
551 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  38.8 
 
 
539 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  38.62 
 
 
568 aa  320  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  41.02 
 
 
507 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  39.89 
 
 
560 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  37.26 
 
 
541 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  37.26 
 
 
551 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  37.26 
 
 
539 aa  317  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 
551 aa  316  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 
551 aa  316  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 
539 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 
539 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  38.29 
 
 
551 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 
539 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  37.07 
 
 
551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 
534 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  38.94 
 
 
534 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  38.68 
 
 
498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  36.41 
 
 
530 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  35.36 
 
 
545 aa  306  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  35.38 
 
 
559 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  35.17 
 
 
545 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  36.45 
 
 
545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  37.52 
 
 
534 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  35.17 
 
 
545 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  37.72 
 
 
537 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 
562 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 
562 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 
608 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 
562 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  35.44 
 
 
597 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  36.99 
 
 
594 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  36.89 
 
 
534 aa  301  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  40.38 
 
 
529 aa  300  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  36.93 
 
 
534 aa  299  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  34.68 
 
 
604 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  34.68 
 
 
604 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 
720 aa  298  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  35.23 
 
 
498 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  34.68 
 
 
558 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  34.43 
 
 
542 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  34.19 
 
 
544 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  34.43 
 
 
542 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  36.55 
 
 
533 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  34.25 
 
 
542 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  34.25 
 
 
542 aa  293  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  34.69 
 
 
540 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  35.51 
 
 
542 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  34.62 
 
 
498 aa  280  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  36.58 
 
 
519 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  35.8 
 
 
550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  35.17 
 
 
539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  39.15 
 
 
528 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  34.69 
 
 
503 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  37.93 
 
 
508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  34.46 
 
 
539 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  35.63 
 
 
519 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  35.85 
 
 
495 aa  270  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  35.76 
 
 
504 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  35.21 
 
 
525 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  35.21 
 
 
525 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  33.87 
 
 
529 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  34.21 
 
 
588 aa  264  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 
559 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  37.86 
 
 
642 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  35.56 
 
 
504 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 
579 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  35.01 
 
 
530 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  33.79 
 
 
503 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  35.01 
 
 
520 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  35.06 
 
 
533 aa  261  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  34.26 
 
 
528 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  34.26 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.95 
 
 
604 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  34.45 
 
 
517 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  34.54 
 
 
522 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03975  glucan biosynthesis protein G  30.74 
 
 
543 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  34.44 
 
 
505 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>