174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2222 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  100 
 
 		 541 aa  1130    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  100 
 
 		 539 aa  1130    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  62.52 
 
 		 539 aa  677    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  62.33 
 
 		 539 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  64.98 
 
 		 542 aa  726    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  89.03 
 
 		 539 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  89.03 
 
 		 539 aa  1020    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  99.44 
 
 		 551 aa  1125    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  62.82 
 
 		 550 aa  702    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  88.48 
 
 		 539 aa  1014    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  88.85 
 
 		 539 aa  1019    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  99.81 
 
 		 539 aa  1127    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  86.62 
 
 		 551 aa  1009    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  76.49 
 
 		 551 aa  898    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 		 539 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  99.63 
 
 		 551 aa  1126    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  99.81 
 
 		 551 aa  1128    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  99.81 
 
 		 539 aa  1127    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1131    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  99.81 
 
 		 539 aa  1127    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  48.79 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  48.13 
 
 		 525 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  45.59 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  46.37 
 
 		 534 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  45.97 
 
 		 534 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  44.23 
 
 		 608 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  44.23 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  45.17 
 
 		 534 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  44.23 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  44.23 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  45.76 
 
 		 530 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  43.65 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  44.17 
 
 		 597 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  43.79 
 
 		 604 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  43.79 
 
 		 604 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  43.79 
 
 		 558 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  44.64 
 
 		 568 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  46.9 
 
 		 507 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  44.27 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  40.63 
 
 		 551 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  41.11 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  41.11 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  41.62 
 
 		 587 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  42.23 
 
 		 540 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  39.24 
 
 		 532 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  41.3 
 
 		 526 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  41.05 
 
 		 498 aa  342  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 		 519 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  40.16 
 
 		 518 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.84 
 
 		 503 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  41.11 
 
 		 524 aa  340  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  37 
 
 		 503 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  39.68 
 
 		 495 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  39.68 
 
 		 504 aa  331  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  37.95 
 
 		 533 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.88 
 
 		 534 aa  330  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  40.28 
 
 		 545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 		 530 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  39 
 
 		 546 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  39.55 
 
 		 531 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  38.65 
 
 		 543 aa  326  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  40.44 
 
 		 528 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  39.35 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  36.95 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  38.54 
 
 		 527 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  36.23 
 
 		 519 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  37.26 
 
 		 584 aa  317  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.95 
 
 		 533 aa  316  6e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  36.71 
 
 		 519 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  38.72 
 
 		 511 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  36.65 
 
 		 642 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 517 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 		 511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  37.83 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  37.83 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  37.83 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  38.31 
 
 		 522 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  38.83 
 
 		 522 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.95 
 
 		 604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.1 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.4 
 
 		 511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.28 
 
 		 528 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  36.69 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  37.78 
 
 		 522 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  37.3 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  36.53 
 
 		 545 aa  301  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  37.3 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  37.63 
 
 		 522 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  36.22 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>