174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1720 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  88.48 
 
 
541 aa  1014    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  88.48 
 
 
539 aa  1014    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  62.33 
 
 
539 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  62.29 
 
 
542 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  99.44 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  62.43 
 
 
550 aa  690    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  99.63 
 
 
539 aa  1120    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 
539 aa  1016    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  78.11 
 
 
551 aa  915    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  84.04 
 
 
551 aa  979    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  88.48 
 
 
551 aa  1014    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  99.44 
 
 
539 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  99.26 
 
 
539 aa  1117    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 
551 aa  1017    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 
551 aa  1016    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  88.29 
 
 
551 aa  1013    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 
539 aa  1016    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
539 aa  1125    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  88.66 
 
 
539 aa  1016    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  49.63 
 
 
534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  48.82 
 
 
525 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  45.21 
 
 
562 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  45.21 
 
 
562 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
608 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  45.21 
 
 
562 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  45.56 
 
 
534 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  45.19 
 
 
534 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  47.41 
 
 
530 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  44.83 
 
 
537 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  46.03 
 
 
534 aa  425  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  46.02 
 
 
568 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  44.64 
 
 
594 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  45.02 
 
 
597 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  44.62 
 
 
604 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  44.62 
 
 
604 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  44.62 
 
 
558 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  48.35 
 
 
507 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  45.92 
 
 
560 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  47.35 
 
 
560 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  41.45 
 
 
551 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  41.11 
 
 
537 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  41.11 
 
 
537 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  43.16 
 
 
540 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  42.03 
 
 
587 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  40.35 
 
 
532 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  42.18 
 
 
526 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  41.32 
 
 
524 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  41.29 
 
 
519 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  40.2 
 
 
498 aa  342  8e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  41.15 
 
 
518 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.73 
 
 
495 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  41.24 
 
 
545 aa  333  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 
503 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  39.76 
 
 
503 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  38.84 
 
 
543 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  37.35 
 
 
533 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  41.04 
 
 
528 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  38.06 
 
 
519 aa  323  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  39.76 
 
 
527 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  39.55 
 
 
531 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  38.8 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  36.95 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.54 
 
 
546 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.5 
 
 
534 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  36.21 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  39.72 
 
 
511 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
517 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  36.42 
 
 
519 aa  310  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  37.7 
 
 
527 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
530 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  38.69 
 
 
520 aa  309  9e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.1 
 
 
511 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.1 
 
 
528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.44 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  36.44 
 
 
517 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  36.44 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  37.52 
 
 
542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  38.05 
 
 
545 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  36.87 
 
 
522 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  37.82 
 
 
522 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  38.23 
 
 
508 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.5 
 
 
522 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  36.04 
 
 
505 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  37.63 
 
 
522 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  35.12 
 
 
642 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  37.3 
 
 
522 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  35.5 
 
 
522 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  36.69 
 
 
525 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>