174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5542 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  61.12 
 
 
541 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  61.02 
 
 
539 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  100 
 
 
539 aa  1125    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  97.03 
 
 
539 aa  1081    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  78.97 
 
 
542 aa  914    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  60.73 
 
 
551 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  56.62 
 
 
550 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  684    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  61.21 
 
 
539 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  60.92 
 
 
551 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  61.21 
 
 
539 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  61.21 
 
 
539 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  60.92 
 
 
551 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  62.39 
 
 
551 aa  717    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  60.92 
 
 
551 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  60.92 
 
 
551 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  61.02 
 
 
539 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  46.47 
 
 
534 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  43.76 
 
 
525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  45.27 
 
 
534 aa  455  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  43.57 
 
 
534 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  43.58 
 
 
594 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  43.65 
 
 
537 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  41.6 
 
 
562 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  42.42 
 
 
604 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  42.42 
 
 
604 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  42.42 
 
 
558 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  41.6 
 
 
562 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  41.6 
 
 
608 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  41.6 
 
 
562 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  42.23 
 
 
597 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  43.58 
 
 
534 aa  425  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  42.67 
 
 
530 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  43.71 
 
 
568 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  45.22 
 
 
507 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  44.23 
 
 
560 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  44.04 
 
 
560 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  41.8 
 
 
537 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  41.8 
 
 
537 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  41.73 
 
 
551 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  42.35 
 
 
532 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  41.62 
 
 
540 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  42.16 
 
 
518 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  40.81 
 
 
519 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 
546 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  39.74 
 
 
526 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  40.87 
 
 
587 aa  346  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  41.27 
 
 
524 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  39.34 
 
 
545 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  39.53 
 
 
495 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  36.93 
 
 
588 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  38.91 
 
 
543 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  37.23 
 
 
533 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  37.52 
 
 
503 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  38.21 
 
 
498 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  39.12 
 
 
504 aa  329  7e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  37.55 
 
 
528 aa  326  7e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  38.92 
 
 
530 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  38.92 
 
 
520 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 
519 aa  323  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
517 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.7 
 
 
534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  38.31 
 
 
542 aa  320  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 
532 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  36.4 
 
 
503 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  37.8 
 
 
517 aa  316  6e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
517 aa  316  6e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
517 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  37.8 
 
 
511 aa  316  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  38.21 
 
 
533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  37.04 
 
 
514 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  37.5 
 
 
522 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  36.11 
 
 
536 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
522 aa  309  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.74 
 
 
522 aa  309  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  36.57 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  36.93 
 
 
522 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  37.7 
 
 
540 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  36.67 
 
 
525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  36.67 
 
 
525 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  35.69 
 
 
519 aa  305  9.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  36.69 
 
 
522 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  37.15 
 
 
527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  36.15 
 
 
541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  37.4 
 
 
522 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  41.4 
 
 
529 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  36.49 
 
 
559 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>