174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2251 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  69.62 
 
 
503 aa  723    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
495 aa  1011    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  67.74 
 
 
503 aa  693    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  52.31 
 
 
545 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  52.31 
 
 
545 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  52.31 
 
 
545 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  52.1 
 
 
544 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  51.89 
 
 
498 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  50.2 
 
 
545 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  51.51 
 
 
519 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  51.16 
 
 
559 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  51.89 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  50.32 
 
 
542 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  50.32 
 
 
542 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  50.32 
 
 
542 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  50.32 
 
 
542 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  49.28 
 
 
498 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  46.19 
 
 
504 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  45.09 
 
 
520 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  46.19 
 
 
530 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  46.58 
 
 
534 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  46.2 
 
 
525 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  45.55 
 
 
519 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  43.81 
 
 
525 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  46.84 
 
 
560 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  42.6 
 
 
525 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  43.81 
 
 
525 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  44.67 
 
 
533 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  44.03 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  46.33 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  43.54 
 
 
530 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  44.15 
 
 
568 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  43.92 
 
 
522 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  45.83 
 
 
528 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  42.83 
 
 
536 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  44.31 
 
 
545 aa  398  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  43.14 
 
 
579 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  41.89 
 
 
511 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  41.55 
 
 
528 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  43.74 
 
 
559 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  44.65 
 
 
532 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  44.18 
 
 
530 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  46.26 
 
 
560 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  45.38 
 
 
514 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  44.03 
 
 
579 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  41.57 
 
 
604 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  42.94 
 
 
594 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  44.88 
 
 
539 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  40.48 
 
 
511 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
517 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
517 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  40.48 
 
 
517 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  41.18 
 
 
597 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
517 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
517 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  40.48 
 
 
511 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  44.79 
 
 
534 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  41.2 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  43.39 
 
 
517 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  41.33 
 
 
522 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  41.37 
 
 
604 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  41.57 
 
 
558 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  41.24 
 
 
522 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  43.53 
 
 
522 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  44.67 
 
 
539 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  41.33 
 
 
522 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  41.2 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  42.15 
 
 
533 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
517 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  41.2 
 
 
608 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
517 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
517 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  41.2 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  43.33 
 
 
559 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  44.54 
 
 
542 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
511 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
511 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
511 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  42.24 
 
 
505 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  44.2 
 
 
534 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  42.06 
 
 
522 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
511 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  41.49 
 
 
531 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  46.22 
 
 
507 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  42.07 
 
 
528 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  42.31 
 
 
588 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  41.28 
 
 
527 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  41.7 
 
 
529 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  41.7 
 
 
529 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  43.91 
 
 
562 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  41.49 
 
 
527 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  41.53 
 
 
604 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  41.06 
 
 
527 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  44.12 
 
 
511 aa  379  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  41.3 
 
 
642 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  43.24 
 
 
522 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  43.04 
 
 
532 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  43.04 
 
 
532 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  40.97 
 
 
529 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  42.07 
 
 
530 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>