174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0710 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  60.19 
 
 		 536 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 530 aa  1067    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1824  glucan biosynthesis protein D  49.5 
 
 		 547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  48.29 
 
 		 562 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3674  glucan biosynthesis protein G  44.98 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  41.94 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3969  glucan biosynthesis protein G  44.98 
 
 		 548 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  40.19 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  40.19 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  40.41 
 
 		 559 aa  388  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  41.53 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.81 
 
 		 545 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  40.29 
 
 		 525 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  43.43 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  40.56 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2986  glucan biosynthesis protein D  45.58 
 
 		 522 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3961  glucan biosynthesis protein D  44.9 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  41.41 
 
 		 544 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.07 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  39.41 
 
 		 534 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  37.42 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  37.53 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  37.01 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  37.01 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  37.01 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  37.53 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  37.53 
 
 		 608 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  37.53 
 
 		 562 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  41.2 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 		 503 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  36.7 
 
 		 594 aa  359  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  37.32 
 
 		 568 aa  356  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  40.55 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  38.88 
 
 		 560 aa  349  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  37.2 
 
 		 530 aa  345  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  36.81 
 
 		 537 aa  345  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  36.81 
 
 		 534 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  36.73 
 
 		 534 aa  343  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  40.08 
 
 		 507 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  38.54 
 
 		 508 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  38.68 
 
 		 560 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  35.77 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  37.87 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  36.98 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  35.92 
 
 		 588 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  35.83 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  35.6 
 
 		 534 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  39.17 
 
 		 532 aa  319  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  39.17 
 
 		 532 aa  319  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  35.87 
 
 		 525 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  36.76 
 
 		 530 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  36.55 
 
 		 520 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  35.87 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  38.28 
 
 		 514 aa  316  7e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  36.55 
 
 		 504 aa  316  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 559 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  34.81 
 
 		 530 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  37.43 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  36.4 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  36.21 
 
 		 504 aa  312  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  36.55 
 
 		 518 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  34.81 
 
 		 533 aa  310  5.9999999999999995e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  36.26 
 
 		 579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  36.26 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  40.44 
 
 		 642 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  36 
 
 		 505 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  35.73 
 
 		 525 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  37.01 
 
 		 532 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  35.65 
 
 		 529 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  35.24 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  35.07 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  36.94 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  35.97 
 
 		 540 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  39.63 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  36.01 
 
 		 542 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  34.03 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  34.86 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  34.86 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  34.86 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  34.86 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  34.72 
 
 		 527 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  33.82 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  36.73 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  33.82 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  34.96 
 
 		 604 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  33.82 
 
 		 511 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  35.43 
 
 		 551 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  36.48 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  33.67 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  35.02 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>