174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2046 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  82.57 
 
 
545 aa  834    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  98.14 
 
 
539 aa  1060    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 
539 aa  1077    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  62.47 
 
 
542 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  60 
 
 
532 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  52.86 
 
 
527 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  49.06 
 
 
533 aa  458  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  46.61 
 
 
542 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  47.03 
 
 
498 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  46.61 
 
 
542 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  45.73 
 
 
498 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  45.94 
 
 
545 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  45.84 
 
 
540 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  46.2 
 
 
542 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  46.31 
 
 
544 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  46.2 
 
 
542 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  45.54 
 
 
545 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  45.54 
 
 
545 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  44.11 
 
 
545 aa  409  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  44.2 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  44.81 
 
 
503 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  44.88 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  40.5 
 
 
597 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  40 
 
 
604 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  40.19 
 
 
604 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  40.19 
 
 
558 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  39.73 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  39.73 
 
 
608 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  43.81 
 
 
519 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  39.73 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  44.12 
 
 
503 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  39.73 
 
 
562 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  43.7 
 
 
525 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 
594 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  40.61 
 
 
568 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  41.73 
 
 
534 aa  375  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  44.89 
 
 
528 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  41.09 
 
 
537 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  44.4 
 
 
504 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  41.46 
 
 
534 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  43.42 
 
 
530 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  43.22 
 
 
520 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  39.92 
 
 
534 aa  362  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
536 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
517 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
517 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.38 
 
 
517 aa  360  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  42.17 
 
 
514 aa  360  5e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
511 aa  360  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
511 aa  360  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
511 aa  360  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
511 aa  360  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.38 
 
 
511 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  39.38 
 
 
511 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  38.38 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
529 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  40.08 
 
 
527 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  39.88 
 
 
529 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  41.31 
 
 
534 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.39 
 
 
546 aa  356  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  39.07 
 
 
527 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.35 
 
 
588 aa  356  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.16 
 
 
517 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  39.68 
 
 
531 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  40.39 
 
 
530 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 
533 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.34 
 
 
517 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
533 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  39.46 
 
 
525 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  40.08 
 
 
519 aa  352  7e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  39.46 
 
 
525 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 
526 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  42.28 
 
 
514 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  38.8 
 
 
528 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  43.3 
 
 
522 aa  351  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  37.74 
 
 
522 aa  350  3e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.45 
 
 
528 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.45 
 
 
511 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 
522 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  41.9 
 
 
511 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  38.9 
 
 
522 aa  346  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 
530 aa  346  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  39.71 
 
 
522 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  41.58 
 
 
532 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  41.58 
 
 
532 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  42.38 
 
 
560 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
522 aa  343  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  40.59 
 
 
505 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  41.89 
 
 
527 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.26 
 
 
534 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  42.49 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
525 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  42.32 
 
 
560 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  38.35 
 
 
522 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3563  glucan biosynthesis protein G  42.52 
 
 
513 aa  334  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  38.95 
 
 
504 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>