174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5076 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  62.48 
 
 		 511 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 511 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  62.48 
 
 		 517 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  97.32 
 
 		 559 aa  1063    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 517 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  62.52 
 
 		 517 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  76.06 
 
 		 641 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  65.76 
 
 		 642 aa  830    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  73.12 
 
 		 604 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  62.52 
 
 		 517 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  70.37 
 
 		 522 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  67.34 
 
 		 525 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  62.52 
 
 		 517 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  70.58 
 
 		 522 aa  740    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  61.18 
 
 		 533 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  65.19 
 
 		 517 aa  661    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  61.68 
 
 		 511 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 517 aa  733    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  98.03 
 
 		 579 aa  1125    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  62.48 
 
 		 511 aa  731    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  66.97 
 
 		 525 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  62.68 
 
 		 522 aa  711    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  64.32 
 
 		 511 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 511 aa  733    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  63.72 
 
 		 505 aa  703    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 511 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  64.58 
 
 		 522 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  62.52 
 
 		 517 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  63.44 
 
 		 522 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  92.84 
 
 		 579 aa  1080    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 559 aa  1147    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  62.34 
 
 		 517 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  64.32 
 
 		 528 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  62.66 
 
 		 511 aa  733    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  55.96 
 
 		 536 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  52.77 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  52.77 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  52.77 
 
 		 520 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  50.74 
 
 		 533 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  49.4 
 
 		 519 aa  520  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  50.11 
 
 		 588 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  50.11 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  45.09 
 
 		 522 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  42.66 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  43.94 
 
 		 527 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  43.21 
 
 		 522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  42.98 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  41.26 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  43.43 
 
 		 503 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  43.82 
 
 		 495 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  42.98 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  41.75 
 
 		 514 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  43.39 
 
 		 604 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  44.42 
 
 		 594 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  42.95 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  39.75 
 
 		 529 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  43.39 
 
 		 604 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  43.39 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  43.05 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  41.42 
 
 		 540 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  43.05 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  43.72 
 
 		 608 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  43.05 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  43.05 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  40.71 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  41.99 
 
 		 540 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  41.19 
 
 		 545 aa  364  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  40.21 
 
 		 532 aa  361  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  41.46 
 
 		 546 aa  360  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  42.36 
 
 		 519 aa  359  8e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  41.72 
 
 		 528 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  40.42 
 
 		 498 aa  356  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  41.78 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  39.5 
 
 		 525 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  39.41 
 
 		 542 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  38.7 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  42.59 
 
 		 530 aa  347  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  40.17 
 
 		 534 aa  344  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  38.77 
 
 		 544 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  39.78 
 
 		 540 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.45 
 
 		 545 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  39.78 
 
 		 540 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 		 545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 		 545 aa  339  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  39.53 
 
 		 534 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.08 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.08 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.24 
 
 		 498 aa  335  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1075  glucan biosynthesis protein D  38.2 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  40.17 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0960  glucan biosynthesis protein D  38.2 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  41.55 
 
 		 560 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  38.64 
 
 		 530 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 545 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  38.76 
 
 		 504 aa  330  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  37.92 
 
 		 559 aa  330  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  37.6 
 
 		 537 aa  329  8e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  40.21 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>