174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0960 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1075  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
514 aa  1059    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0960  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
514 aa  1059    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  37.15 
 
 
533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  37.96 
 
 
522 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  35.65 
 
 
517 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  35.65 
 
 
517 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  35.65 
 
 
517 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.48 
 
 
525 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.48 
 
 
525 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  36.17 
 
 
511 aa  350  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  36.78 
 
 
517 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  36.17 
 
 
511 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  36.17 
 
 
511 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  36.17 
 
 
511 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  36.17 
 
 
511 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  36.78 
 
 
517 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  36.17 
 
 
511 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  36.78 
 
 
517 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  36.78 
 
 
517 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  36.78 
 
 
517 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.01 
 
 
522 aa  349  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  37.82 
 
 
522 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  36.76 
 
 
528 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  37.82 
 
 
529 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  40.99 
 
 
504 aa  347  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  40.79 
 
 
530 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  39.49 
 
 
514 aa  346  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  37.2 
 
 
511 aa  345  8.999999999999999e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  38.75 
 
 
588 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  40.79 
 
 
520 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  37.17 
 
 
522 aa  344  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  38.37 
 
 
498 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 
533 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  36.89 
 
 
522 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  38.49 
 
 
505 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  37.58 
 
 
522 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  37.73 
 
 
579 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 
559 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  37.18 
 
 
511 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  38.2 
 
 
559 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  38.05 
 
 
519 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  37.68 
 
 
579 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  35.56 
 
 
641 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  36.55 
 
 
604 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  35.74 
 
 
536 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  34.95 
 
 
642 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  39.53 
 
 
503 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  35.78 
 
 
517 aa  319  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  36.9 
 
 
498 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  39.45 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 
522 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  39.19 
 
 
560 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  37.83 
 
 
527 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  34.91 
 
 
519 aa  309  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  37.15 
 
 
541 aa  309  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  37.55 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  36.88 
 
 
597 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  36.69 
 
 
604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  36.69 
 
 
604 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  36.69 
 
 
558 aa  306  7e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  35.5 
 
 
534 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  35.18 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  35.18 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  35.18 
 
 
562 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  35.18 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  37.72 
 
 
503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  37.64 
 
 
534 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  35.77 
 
 
594 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  36.04 
 
 
533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  38.34 
 
 
532 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  39.38 
 
 
560 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 
514 aa  297  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  35.79 
 
 
568 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  35.53 
 
 
534 aa  297  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  36.31 
 
 
534 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  35.19 
 
 
530 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  36.36 
 
 
528 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  35.45 
 
 
542 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  34.82 
 
 
545 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  35.22 
 
 
539 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  35.02 
 
 
539 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  37.92 
 
 
508 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  34.51 
 
 
546 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  33.78 
 
 
530 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  39.3 
 
 
559 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  34.72 
 
 
527 aa  280  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  36.92 
 
 
540 aa  280  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  34.91 
 
 
527 aa  279  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  34.75 
 
 
529 aa  277  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  37.47 
 
 
507 aa  276  8e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 
498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  35.29 
 
 
537 aa  274  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 
544 aa  274  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  34.7 
 
 
545 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
545 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  33.99 
 
 
526 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
545 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
545 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  33.59 
 
 
528 aa  272  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  35.57 
 
 
527 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>