174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1830 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  63.05 
 
 
526 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  66.41 
 
 
551 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  66.67 
 
 
540 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  67.95 
 
 
587 aa  693    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  64.68 
 
 
532 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  66.6 
 
 
537 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  66.6 
 
 
537 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  90.72 
 
 
518 aa  931    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  63.38 
 
 
545 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  66.6 
 
 
524 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 
519 aa  1043    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  58.63 
 
 
543 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  50.38 
 
 
534 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  50.4 
 
 
525 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  48.31 
 
 
534 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  47.63 
 
 
534 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  47.57 
 
 
533 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  46.4 
 
 
530 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  48.59 
 
 
529 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  47.95 
 
 
531 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  47.95 
 
 
527 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  48.79 
 
 
527 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  47.44 
 
 
568 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  45.58 
 
 
594 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  44.47 
 
 
597 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  44.85 
 
 
604 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  45.04 
 
 
604 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  45.04 
 
 
558 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  47.25 
 
 
584 aa  420  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  47.8 
 
 
560 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  46.08 
 
 
537 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  45.26 
 
 
562 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  45.26 
 
 
562 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  45.26 
 
 
608 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  46.36 
 
 
534 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  45.26 
 
 
562 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  47.04 
 
 
560 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  48.23 
 
 
507 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  44.2 
 
 
533 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  43.94 
 
 
498 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  41.19 
 
 
539 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  43.16 
 
 
542 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  41.67 
 
 
588 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.91 
 
 
504 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  41.19 
 
 
539 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  41.32 
 
 
551 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  44.85 
 
 
519 aa  364  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.71 
 
 
530 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  42.71 
 
 
520 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  41.9 
 
 
505 aa  359  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  41.75 
 
 
539 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  41.75 
 
 
539 aa  359  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.73 
 
 
503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  41.56 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  41.37 
 
 
539 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  41.37 
 
 
539 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  42.77 
 
 
495 aa  352  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
534 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.96 
 
 
541 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  39.96 
 
 
551 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.96 
 
 
539 aa  349  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
551 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
551 aa  349  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
539 aa  348  9e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
539 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  39.96 
 
 
539 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  39.77 
 
 
551 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  44.09 
 
 
720 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  43.41 
 
 
542 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.79 
 
 
503 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  41.34 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  40.22 
 
 
551 aa  335  9e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  40.73 
 
 
511 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  41.68 
 
 
528 aa  333  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  40.19 
 
 
514 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  40.28 
 
 
498 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  38.87 
 
 
550 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  40.52 
 
 
544 aa  331  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.41 
 
 
545 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  41.08 
 
 
540 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.21 
 
 
545 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.81 
 
 
545 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  37.98 
 
 
519 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  40.53 
 
 
545 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 
498 aa  324  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  39.29 
 
 
527 aa  324  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  38.83 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  38.13 
 
 
559 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.88 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  39.07 
 
 
517 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  39.49 
 
 
542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  39.49 
 
 
542 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  37.2 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  37.2 
 
 
511 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  41.51 
 
 
559 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  40.52 
 
 
540 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  40.52 
 
 
540 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  37.55 
 
 
522 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  41.51 
 
 
579 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>