174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3925 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  99.05 
 
 		 531 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3925  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 527 aa  1069    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.324166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  82.92 
 
 		 527 aa  874    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  47.49 
 
 		 551 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  47.4 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  47.4 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  49.52 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  48.67 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  49.42 
 
 		 532 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  49.18 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  47.28 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4350  glucan biosynthesis protein D  46.54 
 
 		 533 aa  435  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0483582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  48.76 
 
 		 525 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  49 
 
 		 518 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  45.86 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  45.28 
 
 		 534 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  46.42 
 
 		 545 aa  418  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  48.34 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  44.02 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  44.02 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  44.02 
 
 		 608 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  44.02 
 
 		 562 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  45.53 
 
 		 534 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  42.99 
 
 		 597 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  44.69 
 
 		 534 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  43.6 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  43.6 
 
 		 604 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  43.41 
 
 		 558 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  43.76 
 
 		 530 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  42.97 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  42.99 
 
 		 568 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  46.03 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  43.92 
 
 		 560 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  46.42 
 
 		 537 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3488  glucan biosynthesis protein G  44.23 
 
 		 720 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  46.22 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2425  glucan biosynthesis protein G  43.37 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  43.73 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  42.95 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  44.96 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0579  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 		 584 aa  353  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.38621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  43.41 
 
 		 540 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  43.41 
 
 		 540 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 		 533 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  39.3 
 
 		 534 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  40.58 
 
 		 504 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  42.98 
 
 		 528 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  39.04 
 
 		 588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  40.59 
 
 		 579 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  40.79 
 
 		 579 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  40.59 
 
 		 559 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  38.27 
 
 		 525 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  38.27 
 
 		 525 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  38.79 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  38.79 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  38.79 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  38.79 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  38.87 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  40.61 
 
 		 522 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  38.73 
 
 		 551 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.87 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  39.5 
 
 		 530 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  37.9 
 
 		 551 aa  329  7e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  37.9 
 
 		 539 aa  329  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  37.43 
 
 		 604 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  37.9 
 
 		 541 aa  329  9e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 551 aa  329  9e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 539 aa  329  9e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  39.5 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  37.9 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  38.84 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  38.42 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  39.54 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 536 aa  326  8.000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  39.14 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  39.47 
 
 		 517 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 		 517 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.02 
 
 		 517 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.67 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.93 
 
 		 522 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  40.12 
 
 		 529 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  38.01 
 
 		 533 aa  320  5e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  38.03 
 
 		 642 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  39.1 
 
 		 522 aa  319  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  38.45 
 
 		 641 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  39.17 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  38.21 
 
 		 517 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  38.21 
 
 		 517 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  38.21 
 
 		 517 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  38.62 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  38.62 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  38.62 
 
 		 511 aa  317  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>