174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1038 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01381  glucan biosynthesis protein, periplasmic  65.11 
 
 		 541 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2222  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  64.98 
 
 		 539 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.834174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1535  glucan biosynthesis protein D  62.48 
 
 		 539 aa  704    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5542  periplasmic glucan biosynthesis protein, putative  78.41 
 
 		 539 aa  900    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5085  glucan biosynthesis protein D  78.41 
 
 		 539 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1038  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 542 aa  1128    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667596 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1720  glucan biosynthesis protein D  62.29 
 
 		 539 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.29319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1649  glucan biosynthesis protein D  64.47 
 
 		 551 aa  736    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0218  glucan biosynthesis protein D  59.34 
 
 		 550 aa  692    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.451813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1800  glucan biosynthesis protein D  62.48 
 
 		 539 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2029  glucan biosynthesis protein D  64.98 
 
 		 539 aa  725    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.511288  hitchhiker  0.0000000000014294 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01393  hypothetical protein  64.84 
 
 		 551 aa  740    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1740  glucan biosynthesis protein D  62.48 
 
 		 539 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1971  glucan biosynthesis protein D  63.49 
 
 		 551 aa  732    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3122  glucan biosynthesis protein D  65.14 
 
 		 551 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1506  glucan biosynthesis protein D  64.84 
 
 		 551 aa  739    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1603  glucan biosynthesis protein D  64.84 
 
 		 551 aa  739    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1750  glucan biosynthesis protein D  64.98 
 
 		 539 aa  725    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5781800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1736  glucan biosynthesis protein D  62.29 
 
 		 539 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.403462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2235  glucan biosynthesis protein D  64.98 
 
 		 539 aa  725    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.720704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  48.7 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  47.25 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  48.51 
 
 		 525 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  46.36 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  46.55 
 
 		 594 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  46.36 
 
 		 608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  46.36 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  46.36 
 
 		 562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  46.06 
 
 		 537 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  45.77 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 		 597 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 		 604 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  45.79 
 
 		 558 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  46.11 
 
 		 568 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  45.74 
 
 		 534 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  44.73 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  46.42 
 
 		 507 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  45.3 
 
 		 560 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  45.3 
 
 		 560 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  43.01 
 
 		 551 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  43.01 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  43.01 
 
 		 537 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  42.91 
 
 		 532 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  42.15 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  43.36 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  41.19 
 
 		 526 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3145  glucan biosynthesis protein D  42.17 
 
 		 587 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.680509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  43.07 
 
 		 519 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  40.54 
 
 		 533 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  40.79 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  41.22 
 
 		 545 aa  350  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  40 
 
 		 543 aa  349  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0309  glucan biosynthesis protein D  41.54 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.105362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  39.72 
 
 		 498 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  39.72 
 
 		 504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  38.95 
 
 		 546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 		 530 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.52 
 
 		 495 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 		 520 aa  334  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  37.64 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  37.64 
 
 		 517 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  38.91 
 
 		 519 aa  331  2e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  37.64 
 
 		 517 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  37.64 
 
 		 517 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  39.44 
 
 		 511 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  37.64 
 
 		 517 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  39.44 
 
 		 528 aa  332  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  38.96 
 
 		 534 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  38.43 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  38.46 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  39.24 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  39.03 
 
 		 542 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  37.17 
 
 		 519 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  38.68 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  38.29 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  38.31 
 
 		 533 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  37.66 
 
 		 532 aa  316  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  39.84 
 
 		 540 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  36.7 
 
 		 522 aa  314  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  36.67 
 
 		 541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  38.18 
 
 		 522 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  38.83 
 
 		 528 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  37.98 
 
 		 522 aa  312  7.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  37.6 
 
 		 522 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  36.89 
 
 		 536 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  37.3 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3185  glucan biosynthesis protein D  38.99 
 
 		 527 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.657429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  36.04 
 
 		 525 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3187  glucan biosynthesis protein D  39.36 
 
 		 531 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  36.04 
 
 		 525 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  36.62 
 
 		 503 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>