103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_29760  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  100 
 
 		 414 aa  841    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0369  monooxygenase FAD-binding  39.07 
 
 		 418 aa  262  8.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2225  FAD-binding monooxygenase  29.25 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1723  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11008  Squalene epoxidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q27PP1]  25 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.606924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1650  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  24.22 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  25.14 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  23.65 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  24.28 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6617  monooxygenase FAD-binding  23.93 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  23.36 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  28.89 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  23.5 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  25.44 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  30.51 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.31 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.31 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  29.44 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  24.02 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  22.54 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  22.09 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  28.02 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.03 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2573  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.77 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  22.1 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1535  monooxygenase, FAD-binding  24.41 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  25.84 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  22.1 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  24.3 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  24.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  24.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  22.1 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.03 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.18 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  25.4 
 
 		 575 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  22.1 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.43 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  26.98 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0681  monooxygenase, FAD-binding  22.44 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  26.6 
 
 		 597 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  22.97 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  22.35 
 
 		 422 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  23.01 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  23.33 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  41.67 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  38.71 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  21.96 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1139  ubiquinone biosynthesis hydroxylase  22.67 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  23.85 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  21.98 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  21.64 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  25.4 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  24.63 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0818  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  23.64 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.15699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.73 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  21.84 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0904  putative monooxygenase  23.53 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  20.89 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  21.65 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  29.78 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  27.67 
 
 		 540 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  25.14 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  27.13 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  27.51 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  23.58 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  29.21 
 
 		 502 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  23.28 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  29.21 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.24 
 
 		 506 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3796  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.63 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0336813  normal  0.0760844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.81 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  42.86 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  20.2 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  28.33 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 434 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  25.24 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  25.24 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  42.19 
 
 		 507 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6220  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  29.17 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.98 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  28.49 
 
 		 489 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 		 411 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.07 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>