68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0412 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  93.06 
 
 		 216 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  46.33 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  49.31 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  53.5 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  52.5 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  47.89 
 
 		 204 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  52.17 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  41.58 
 
 		 387 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  38.46 
 
 		 313 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  45.2 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  31.71 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  35.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  28.7 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  34.85 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  31.05 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  29.2 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  31.16 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  26.74 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  32.12 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  36.61 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  35.98 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  29.19 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  34.95 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  28.93 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3374  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  35.81 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  31.1 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.59 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  28 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.42 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  40 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  28.43 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3891  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  32.42 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.614705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2807  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.93 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  24.5 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  24.38 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  31.28 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.88 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2445  purine or other phosphorylase family 1  31.75 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  24.38 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0601  MTA/SAH nucleosidase  22.51 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  30.77 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1299  MTA/SAH nucleosidase  35.94 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0016425  hitchhiker  0.0031404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  24.38 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1220  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.49 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4955  hypothetical protein  31.82 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4147  hypothetical protein  38.75 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127542  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0776  adenosylhomocysteine nucleosidase  33.72 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.217989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.49 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.87 
 
 		 459 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.87 
 
 		 459 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.77 
 
 		 232 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1040  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.05 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.75 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1001  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.88 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0497  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.88 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.36672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1115  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.13 
 
 		 230 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2966  adenosylhomocysteine nucleosidase  23.62 
 
 		 230 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.02 
 
 		 268 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  24.12 
 
 		 230 aa  42  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>