32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0152 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  75.91 
 
 
387 aa  401  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  38.6 
 
 
235 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  35.74 
 
 
234 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  41.84 
 
 
213 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  38.54 
 
 
215 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  44.8 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  35.19 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  33.66 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  34.98 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  44.16 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  26.32 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  37.8 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  41.11 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  30 
 
 
242 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  28.93 
 
 
243 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  24.88 
 
 
210 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  43.48 
 
 
248 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.48 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  35 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  41.56 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  40.54 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  36.71 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  40 
 
 
243 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  42.25 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  33.65 
 
 
224 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  31.76 
 
 
252 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  30.6 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  24.07 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  28.33 
 
 
223 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  36.59 
 
 
236 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>