34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4421 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  100 
 
 		 387 aa  755    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  75.99 
 
 		 313 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  31.92 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  35.4 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  38.42 
 
 		 215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  38.78 
 
 		 213 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  45.76 
 
 		 244 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  41.1 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  42.01 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  42.86 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  32.5 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  31.19 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  42.35 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  41.18 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  26.5 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  40.79 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  31.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  44.16 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  27.54 
 
 		 242 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  42.11 
 
 		 239 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  35.16 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  37.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  33.71 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  27.85 
 
 		 223 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  39.19 
 
 		 239 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  36.99 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  37.66 
 
 		 258 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  47.22 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  29.72 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  35.37 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.81 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  23.96 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  22.71 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>