69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0986 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
222 aa  448  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  68.02 
 
 
223 aa  305  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  36.44 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  33.19 
 
 
255 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  35.64 
 
 
242 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  35.29 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  34.5 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  33.33 
 
 
242 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  28.64 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  34.65 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  30.1 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  31.67 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2619  Adenosylhomocysteine nucleosidase  29.17 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000352844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  30.99 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1748  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.99 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0816113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  34.86 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  32.77 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  29.8 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  29.83 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11070  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.21 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0308567  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  30.69 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.83 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  29.46 
 
 
252 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  25.87 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  32.26 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0927  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28.32 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0223  Adenosylhomocysteine nucleosidase  28.89 
 
 
279 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172084  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  25.46 
 
 
210 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  27.27 
 
 
234 aa  52  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  27.95 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2188  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.67 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.02 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1515  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.39 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.266051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  32.45 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.16 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0152  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  31.21 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00286407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0422  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  30.53 
 
 
258 aa  48.5  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0977  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.75 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0112  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.9 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4743  MTA/SAH nucleosidase  27.32 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10092  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  28 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.520049  normal  0.244125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2796  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.94 
 
 
316 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426752  normal  0.379956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2004  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.56 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0671323  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  30.27 
 
 
236 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1616  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.01 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.73 
 
 
228 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.73 
 
 
228 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.59 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0124  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.32 
 
 
228 aa  46.2  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0287728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3198  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.78 
 
 
284 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  27.04 
 
 
224 aa  45.1  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  23.96 
 
 
387 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  30.82 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4313  adenosylhomocysteine nucleosidase  28.57 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1589  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.36 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1682  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.76 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0526  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.12 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.93 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1535  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.91 
 
 
229 aa  43.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  33.67 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2476  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.86 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0384  Adenosylhomocysteine nucleosidase  27.89 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.799751  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1358  purine or other phosphorylase family 1  22.49 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.806507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2076  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.5 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.806649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3729  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.39 
 
 
234 aa  42.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0841667  n/a   
 
 
-
 
NC_011785  BbuZS7_I07  MTA/SAH nucleosidase  20.64 
 
 
271 aa  42  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.179437  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.99 
 
 
231 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1564  purine phosphorylase family 1  25.73 
 
 
270 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>