68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6958 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 		 216 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  35.65 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  30 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  31.67 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  27.43 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  27.93 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  26.36 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  28.88 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  30.38 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  26.34 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  26.67 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  29.89 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  27.46 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  26.86 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  24.9 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  31.01 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  26.61 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  27.98 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  25 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  27.14 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  26.05 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  38.36 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  26.29 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  27.94 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  25.77 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  26.34 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  30.14 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1702  phosphorylase; S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.66 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  26.92 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  25.71 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1957  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.36 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.09 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  25.32 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.71 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2673  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.41 
 
 		 459 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0852435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2915  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.3 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2866  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.41 
 
 		 459 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2872  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.9 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000143207 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2595  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.41 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0227  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.54 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1108  methylthioadenosine nucleosidase  24.52 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.736745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2626  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.41 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478413  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3098  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.48 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1179  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.29 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2014  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0698  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.36 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1027  methylthioadenosine nucleosidase  26.57 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  26.38 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0230  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.632822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0244  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0228  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.819967 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2305  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.11 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0335853  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0246  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.11 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0670161  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26221  predicted protein  24.69 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193959  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5287  Adenosylhomocysteine nucleosidase  22.58 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2620  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  22.63 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0268826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2792  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  23.16 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106649  hitchhiker  0.00000038257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  24.88 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2897  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  23.81 
 
 		 458 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000336981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2638  S-adenosylhomocysteine nucleosidase  21.37 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.316636  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1656  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.16 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1691  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.16 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0105  MTA/SAH nucleosidase  24.89 
 
 		 240 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.97461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.77 
 
 		 231 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2130  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.57 
 
 		 232 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.343593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2671  bifunctional 5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase/phosphatase  24.7 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00923  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.05 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>