39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0447 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  424  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  44.93 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  47.42 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  50.32 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  50.96 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  40.43 
 
 
239 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  40.53 
 
 
242 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  38.83 
 
 
243 aa  99  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  38.38 
 
 
255 aa  94.7  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  36.7 
 
 
242 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  46.92 
 
 
244 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  35.79 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  35.48 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  37.3 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1278  purine phosphorylase family 1  34.62 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  42.38 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  33.51 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  38.35 
 
 
204 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  28.89 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  44.3 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  28.45 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  32.84 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  46.67 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  32.51 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  32.85 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  33.15 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  28.38 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  48.68 
 
 
313 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  31.91 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2560  MTA/SAH nucleosidase  24.69 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0066  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.85 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0063  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.26 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.720122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  31.09 
 
 
236 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01627  5-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.18 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1299  MTA/SAH nucleosidase  42.11 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0016425  hitchhiker  0.0031404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  31.72 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26221  predicted protein  28.14 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193959  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004471  5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  24.18 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0518  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.67 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>