44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4151 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4151  purine or other phosphorylase family 1  100 
 
 
210 aa  431  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532165  hitchhiker  0.00764353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6958  purine or other phosphorylase family 1  35.65 
 
 
216 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.514137  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8090  purine or other phosphorylase family 1  35.71 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4200  hypothetical protein  31.64 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4421  nucleoside phosphorylase-like  32.5 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.387402  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3235  hypothetical protein  32.09 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2491  purine or other phosphorylase family 1  30.41 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3188  hypothetical protein  27.66 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0261  hypothetical protein  27.86 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2414  futalosine nucleosidase  27.72 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115954 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3009  purine or other phosphorylase family 1  27.04 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5857  purine or other phosphorylase family 1  30.87 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0412  hypothetical protein  26.53 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.302438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0500  hypothetical protein  29.45 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0861636  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0152  hypothetical protein  28.07 
 
 
313 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0453  MTA/SAH nucleosidase  27.47 
 
 
243 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0447  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.502291  normal  0.222261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3274  purine phosphorylases family protein 1  29.76 
 
 
255 aa  52  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0209  hypothetical protein  26.61 
 
 
236 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131467  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0598  purine or other phosphorylase family 1  26.13 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00527656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0986  purine or other phosphorylase family 1  26.6 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1911  purine or other phosphorylase family 1  25.69 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0458  purine or other phosphorylase family 1  26.04 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0612  purine or other phosphorylase family 1  26.5 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6094499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3381  purine phosphorylase family protein 1  26.19 
 
 
243 aa  48.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1255  futalosine nucleosidase  24.62 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.998533  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0685  purine phosphorylase family 1  23.4 
 
 
239 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126276  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1814  purine phosphorylases family protein 1  25.64 
 
 
298 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.651244  normal  0.123727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1253  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.190743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3137  Adenosylhomocysteine nucleosidase  25.93 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.603402 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1220  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.51 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3117  methylthioadenosine nucleosidase  34.92 
 
 
248 aa  45.1  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000730148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2801  methylthioadenosine nucleosidase  27.18 
 
 
230 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.783975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0855  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.23 
 
 
251 aa  45.1  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.391671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1176  adenosylhomocysteine nucleosidase  25.51 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.633739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0106  hypothetical protein  30.08 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2966  adenosylhomocysteine nucleosidase  27.54 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3052  methylthioadenosine nucleosidase  26.21 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0299405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1134  adenosylhomocysteine nucleosidase  26.7 
 
 
231 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.459075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2956  methylthioadenosine nucleosidase  26.21 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0322899 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0205  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  27.07 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2874  methylthioadenosine nucleosidase  26.21 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.326175  hitchhiker  0.00179592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1322  5-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.73 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2565  5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  25.11 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000339129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>